RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479433.5

FBXO18-211, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 3

Gene FBXO18, Length 527 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-211ENST00000479433 IGKV1-17P01599 117 aa4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 CD3DP04234 171 aa4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 RCVRNP35243 200 aa4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 DEFB135Q30KP9 77 aa4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 SPINK9Q5DT21 86 aa4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 TOMM20LQ6UXN7 152 aa4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 SLC16A13Q7RTY0 426 aa4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 LYG2Q86SG7 212 aa4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 SNX29P2Q8IUI4 249 aa4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 CROCCP3Q8IVE0 287 aa4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 APRG1Q8IVJ8 170 aa4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 SOSTQ9BQB4 213 aa4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 AIFM2Q9BRQ8 373 aa4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 MTFP1Q9UDX5 166 aa4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 PRNDQ9UKY0 176 aa4.69□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa4.68□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa4.68□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa4.68□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa4.68□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 ST8SIA3O43173 380 aa4.68□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 TNFAIP8O95379 198 aa4.68□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 UCP1P25874 307 aa4.68□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 SPCS2Q15005 226 aa4.68□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 SLC38A6Q8IZM9 456 aa4.68□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 KIR2DL5AQ8N109 375 aa4.68□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 OR13C8Q8NGS7 320 aa4.68□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa4.68□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 ST8SIA2Q92186 375 aa4.68□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 HINT2Q9BX68 163 aa4.68□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 U3KQE9 123 aa4.68□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 CTDSP2O14595 271 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 SPRY2O43597 315 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 SNAPC5O75971 98 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 TMEM50AO95807 157 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 PIGPP57054 158 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 ERVK-16P61578 105 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 PRR20EP86478 221 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 PRR20CP86479 221 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 PRR20DP86480 221 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 PRR20BP86481 221 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 PRR20AP86496 221 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 SP6Q3SY56 376 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 FAAP20Q6NZ36 180 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 CMTM1Q8IZ96 169 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 STPG3Q8N7X2 389 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 GLYATL2Q8WU03 294 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 BORCS5Q969J3 196 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 TMEM230Q96A57 120 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 TXN2Q99757 166 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 C20orf24Q9BUV8 137 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 THYN1Q9P016 225 aa4.67□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 OR4C46A6NHA9 309 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 K7EQG2 157 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 UBE2CO00762 179 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 DFFBO76075 338 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 CDS2O95674 445 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 C4BPBP20851 252 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 BMI1P35226 326 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 ETV6P41212 452 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 RPL5P46777 297 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 PPP5CP53041 499 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 MFAP4P55083 255 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 ANKRD55Q3KP44 614 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 Q56UQ5 140 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 GPR107Q5VW38 600 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 ARRDC1Q8N5I2 433 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 Q8NAQ8 132 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 TMEM229BQ8NBD8 167 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 UBAC2Q8NBM4 344 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 TMEM116Q8NCL8 245 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 TERB2Q8NHR7 220 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 DCANP1Q8TF63 244 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 MISP3Q96FF7 219 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 GALNT14Q96FL9 552 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 C17orf77Q96MU5 243 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 TMEM56Q96MV1 263 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 TSC22D3Q99576 134 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 MS4A6AQ9H2W1 248 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 FKBP11Q9NYL4 201 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 EXTL2Q9UBQ6 330 aa4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
FBXO18-211ENST00000479433 FAT1Q14517 4588 aa4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.8 ms