RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478044.1

CUL2-208, Transcript of cullin 2, human

TSL 3

Gene CUL2, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUL2-208	ENST00000478044	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044		G3V4G9	280 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	ADAP1	O75689	374 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	DHFR	P00374	187 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	CRYGC	P07315	174 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	FGF2	P09038	288 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	OR4E1	P0C645	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	CTRB1	P17538	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	SLC6A1	P30531	599 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	SNCA	P37840	140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	MFAP2	P55001	183 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	SRPX	P78539	464 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	ZNF616	Q08AN1	781 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	ASAH1	Q13510	395 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	NECAP1	Q8NC96	275 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	OR1S1	Q8NH92	325 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	ENKUR	Q8TC29	256 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	P2RX4	Q99571	388 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044		A0A0B4J2A0	478 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	LINC01619	G3V211	115 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	OR2C1	O95371	312 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	CLEC3B	P05452	202 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	OR8U8	P0C7N1	319 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	SPCS3	P61009	180 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	RUNX1	Q01196	453 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	DHRS2	Q13268	280 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	LYG2	Q86SG7	212 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	CADM3	Q8N126	398 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	PALMD	Q9NP74	551 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044		A0A1B0GU03	582 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	OR2T8	A6NH00	312 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	MPTX1	A8MV57	137 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	BMPR1B	O00238	502 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CUL2-208	ENST00000478044	OVOL1	O14753	267 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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