RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468077.5

TARBP1-204, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, human

TSL 3

Gene TARBP1, Length 514 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP1-204	ENST00000468077	KRAS	P01116	189 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	RLN1	P04808	185 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	HERV-K104	P61576	105 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	C12orf74	Q32Q52	190 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	MT-CO2	P00403	227 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	IFNA21	P01568	189 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	IFNA17	P01571	189 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	IGHV3-48	P01763	117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	F2R	P25116	425 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	NPY1R	P25929	384 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	C22orf42	Q6IC83	251 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	TPRA1	Q86W33	373 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	HOGA1	Q86XE5	327 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	LILRB2	Q8N423	598 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	KNCN	A6PVL3	124 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	NOTO	A8MTQ0	251 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	ZNF688	P0C7X2	276 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	G6PC	P35575	357 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	TSC22D3	Q99576	134 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	CD74	P04233	296 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	FCER2	P06734	321 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	LPAR6	P43657	344 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	NPBWR1	P48145	328 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077		Q6ZR54	194 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077		Q6ZRM9	215 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	CADM3	Q8N126	398 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	ZNF114	Q8NC26	417 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077		A0A1W2PS18	150 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077		K7EQG2	157 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	MOB3A	Q96BX8	217 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARBP1-204	ENST00000468077	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	DBX1	A6NMT0	343 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	C16orf90	A8MZG2	172 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	CDK2AP2	O75956	126 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	GNRHR	P30968	328 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	NPPC	P23582	126 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	P2RY1	P47900	373 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	METTL26	Q96S19	204 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	EHF	Q9NZC4	300 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077		A0A1B0GU03	582 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	EBAG9	O00559	213 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	CBX5	P45973	191 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	PRCD	Q00LT1	54 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	OR4A16	Q8NH70	328 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	DCANP1	Q8TF63	244 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	FAM210B	Q96KR6	192 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	IFT46	Q9NQC8	304 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	AQP4	P55087	323 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	PSMG4	Q5JS54	123 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077		A0A0A6YYH2	397 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	HELT	A6NFD8	242 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077		A6NJ64	397 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	SCGB2A1	O75556	95 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	DHRS2	Q13268	280 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	RNF212	Q495C1	297 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TARBP1-204	ENST00000468077	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		11.1	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms