RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRSS3P35030 304 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FXYD4P59646 89 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GNB1P62873 340 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PITPNAQ00169 270 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q6ZS49 121 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q8N6K4 173 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF221Q9UK13 617 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H0YJW9 148 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H7C2Y5 167 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MOSP00540 346 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGLV2-11P01706 119 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CD1BP29016 333 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACTBP60709 375 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF876PQ49A33 203 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MCFD2Q8NI22 146 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPX8Q8TED1 209 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C16orf95Q9H693 158 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EHFQ9NZC4 300 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MPTX1A8MV57 137 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ITGB1BP1O14713 200 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLXNB1O43157 2135 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGKV1-16P04430 117 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR5H8P0DN80 308 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CD28P10747 220 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HRH1P35367 487 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EBI3Q14213 229 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDK10Q15131 360 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MMDQ15546 238 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q8N9W7 124 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLCC1Q96S66 551 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPYP01298 95 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CTXN2P0C2S0 81 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CBX5P45973 191 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IL18Q14116 193 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF329Q86UD4 541 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PARLQ9H300 379 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBXL15Q9H469 300 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.44□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR5H14A6NHG9 310 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FCN1O00602 326 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CD3DP04234 171 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RCVRNP35243 200 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SEC61GP60059 68 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SRPXP78539 464 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDPQ00604 133 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q8N2B8 174 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GAB2Q9UQC2 676 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1B0GUS0 222 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms