RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 LINC00312Q9Y6C7 94 aa5.66□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 GLI3P10071 1580 aa5.66□□□□□ -1.5
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USP46-201ENST00000441222 NDUFA3O95167 84 aa5.65□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 MGST2Q99735 147 aa5.65□□□□□ -1.5
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USP46-201ENST00000441222 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.65□□□□□ -1.5
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USP46-201ENST00000441222 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
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USP46-201ENST00000441222 UCP1P25874 307 aa5.65□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 SEC11AP67812 179 aa5.65□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 ASPHD2Q6ICH7 369 aa5.65□□□□□ -1.5
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USP46-201ENST00000441222 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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USP46-201ENST00000441222 COL24A1Q17RW2 1714 aa5.65□□□□□ -1.51
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USP46-201ENST00000441222 CD160O95971 181 aa5.65□□□□□ -1.51
USP46-201ENST00000441222 IGKV1D-33P01593 117 aa5.65□□□□□ -1.51
USP46-201ENST00000441222 IGKV1-33P01594 117 aa5.65□□□□□ -1.51
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USP46-201ENST00000441222 ZNF585BQ52M93 769 aa5.65□□□□□ -1.51
USP46-201ENST00000441222 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
USP46-201ENST00000441222 SLC25A38Q96DW6 304 aa5.65□□□□□ -1.51
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USP46-201ENST00000441222 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
USP46-201ENST00000441222 TMEM52Q8NDY8 209 aa5.65□□□□□ -1.51
USP46-201ENST00000441222 C14orf144Q96I85 54 aa5.65□□□□□ -1.51
USP46-201ENST00000441222 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
USP46-201ENST00000441222 CGAP01215 116 aa5.64□□□□□ -1.51
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USP46-201ENST00000441222 ZPLD1Q8TCW7 415 aa5.64□□□□□ -1.51
USP46-201ENST00000441222 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
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USP46-201ENST00000441222 A8MWV9 139 aa5.64□□□□□ -1.51
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USP46-201ENST00000441222 FHITP49789 147 aa5.64□□□□□ -1.51
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USP46-201ENST00000441222 YPEL2Q96QA6 119 aa5.64□□□□□ -1.51
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USP46-201ENST00000441222 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa5.64□□□□□ -1.51
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USP46-201ENST00000441222 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.64□□□□□ -1.51
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USP46-201ENST00000441222 SMIM10L1P0DMW3 83 aa5.63□□□□□ -1.51
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USP46-201ENST00000441222 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.63□□□□□ -1.51
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USP46-201ENST00000441222 JPT2Q9H910 190 aa5.63□□□□□ -1.51
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USP46-201ENST00000441222 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa5.63□□□□□ -1.51
USP46-201ENST00000441222 LINC00614P0C842 121 aa5.63□□□□□ -1.51
USP46-201ENST00000441222 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
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