RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439875.1

FAM225B-202, Transcript of family with sequence similarity 225 member B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAM225B, Length 7,380 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM225B-202ENST00000439875 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
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FAM225B-202ENST00000439875 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.73□□□□□ -1.01
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FAM225B-202ENST00000439875 A0A1B0GTI1 187 aa8.73□□□□□ -1.01
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