RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa12.47□□□□□ -0.41
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C1QTNF9P0C862 333 aa12.47□□□□□ -0.41
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MORN2Q502X0 79 aa12.47□□□□□ -0.41
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EPDR1Q9UM22 224 aa12.47□□□□□ -0.41
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 CLDN16Q9Y5I7 305 aa12.47□□□□□ -0.41
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 RBMY1CP0DJD4 496 aa12.47□□□□□ -0.41
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 WFDC1Q9HC57 220 aa12.46□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WNK3Q9BYP7 1800 aa12.46□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1W2PRE2 83 aa12.45□□□□□ -0.42
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 TAF1LQ8IZX4 1826 aa12.45□□□□□ -0.42
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 C9orf106Q8NAJ2 232 aa12.45□□□□□ -0.42
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM71F2Q6NXP2 309 aa12.45□□□□□ -0.42
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 ST20Q9HBF5 79 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPAG17Q6Q759 2223 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ABHD17AQ96GS6 310 aa12.45□□□□□ -0.42
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 PSME4Q14997 1843 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NINQ8N4C6 2090 aa12.45□□□□□ -0.42
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa12.45□□□□□ -0.42
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ID3Q02535 119 aa12.44□□□□□ -0.42
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 LINC00587B1AMM8 73 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRR32B1ATL7 298 aa12.43□□□□□ -0.42
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM133Q9H2Q1 129 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DPM2O94777 84 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR9G9P0C7N8 305 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DPH3Q96FX2 82 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM242Q9NWH2 141 aa12.43□□□□□ -0.42
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYOD1P15172 320 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIST1H2BOP23527 126 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIST1H2BBP33778 126 aa12.43□□□□□ -0.42
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIST1H2BCP62807 126 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CFHR1Q03591 330 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIST2H2BEQ16778 126 aa12.43□□□□□ -0.42
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIST1H2BHQ93079 126 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VWCEQ96DN2 955 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIST1H2BNQ99877 126 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIST1H2BMQ99879 126 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LINC00614P0C842 121 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCL3L1P16619 93 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EFNB3Q15768 340 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CFAP161Q6P656 301 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DERL1Q9BUN8 251 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CD55P08174 381 aa12.42□□□□□ -0.42
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