RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 LYNX1P0DP58 116 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 CEACAM3P40198 252 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 RNF212Q495C1 297 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 MMD2Q8IY49 270 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 PNKDQ8N490 385 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 KIR3DL3Q8N743 410 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 Q8N7P7 452 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 SLC35E1Q96K37 410 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 HINT2Q9BX68 163 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 SIRT7Q9NRC8 400 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 INSIG2Q9Y5U4 225 aa8.09□□□□□ -1.11
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POLR1A-204ENST00000424089 PLCE1Q9P212 2302 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 LOC105371242A0A075B767 164 aa8.08□□□□□ -1.12
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POLR1A-204ENST00000424089 SOD3P08294 240 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 FOLR2P14207 255 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 CDKN1AP38936 164 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 HNF4GQ14541 408 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 AVPI1Q5T686 147 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.08□□□□□ -1.12
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POLR1A-204ENST00000424089 MGST2Q99735 147 aa8.08□□□□□ -1.12
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POLR1A-204ENST00000424089 TMEM160Q9NX00 188 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 ZNRD1Q9P1U0 126 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa8.07□□□□□ -1.12
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POLR1A-204ENST00000424089 CXorf1O96002 111 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 PRTN3P24158 256 aa8.07□□□□□ -1.12
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POLR1A-204ENST00000424089 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
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POLR1A-204ENST00000424089 PRR20DP86480 221 aa8.07□□□□□ -1.12
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POLR1A-204ENST00000424089 PRR20AP86496 221 aa8.07□□□□□ -1.12
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POLR1A-204ENST00000424089 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 OR4P4Q8NGL7 312 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 RPEQ96AT9 228 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 RNF2Q99496 336 aa8.07□□□□□ -1.12
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POLR1A-204ENST00000424089 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 DSCAML1Q8TD84 2053 aa8.07□□□□□ -1.12
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POLR1A-204ENST00000424089 YIF1AO95070 293 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV4-39P01824 125 aa8.06□□□□□ -1.12
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POLR1A-204ENST00000424089 STAG3L2P0CL84 134 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 STAG3L3P0CL85 134 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 SRD5A1P18405 259 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 HTR1DP28221 377 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 DSCR9P59020 149 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 PAX2Q02962 417 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 PRSS8Q16651 343 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 CLEC2AQ6UVW9 174 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 MOB3BQ86TA1 216 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF114Q8NC26 417 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 DPM3Q9P2X0 92 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 ONECUT1Q9UBC0 465 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 MLXQ9UH92 298 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 C22orf46C9J442 243 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A17O43808 307 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-204ENST00000424089 FBP1P09467 338 aa8.05□□□□□ -1.12
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