RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421202.5

CCDC18-AS1-205, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC18-AS1, Length 2,973 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DERL3Q96Q80 235 aa5□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SDF2Q99470 211 aa5□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 UQCR10Q9UDW1 63 aa5□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NSG2Q9Y328 171 aa5□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TEX15Q9BXT5 2789 aa5□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ABCA12Q86UK0 2595 aa5□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MPDZO75970 2070 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 F8VVB4 439 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 F8VWA3 439 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 H7C1C5 153 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SYNGR1O43759 233 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 REM1O75628 298 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HMGN3Q15651 99 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TMEM18Q96B42 140 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PGLYRP3Q96LB9 341 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TMEM133Q9H2Q1 129 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 VSIRQ9H7M9 311 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IGLC7A0M8Q6 106 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TMEM212A6NML5 194 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 H0YJW9 148 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GABRPO00591 440 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PTHP01270 115 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TRGC2P03986 189 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SFTA3P0C7M3 94 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GP9P14770 177 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF92Q03936 586 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 AADACL3Q5VUY0 350 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SLC35F2Q8IXU6 374 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GCSAMQ8N6F7 178 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TPRX1Q8N7U7 411 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RHNO1Q9BSD3 238 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GGTLC1Q9BX51 225 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TVP23BQ9NYZ1 205 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LRBAP50851 2863 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TACC2O95359 2948 aa4.99□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 APCP25054 2843 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MGST3O14880 152 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 OR2H2O95918 312 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CGAP01215 116 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CD8AP01732 235 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 APOA2P02652 100 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IGLC6P0CF74 106 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TEX36Q5VZQ5 186 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FAM168AQ92567 244 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NOTCH2Q04721 2471 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TMEM178BH3BS89 294 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GNGT2O14610 69 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 H1F0P07305 194 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF136P52737 540 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HIST1H3AP68431 136 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 H3F3AP84243 136 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SRYQ05066 204 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CDSNQ15517 529 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 Q5XG85 94 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SLC18B1Q6NT16 456 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TTC9CQ8N5M4 171 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TMEM229BQ8NBD8 167 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RNF128Q8TEB7 428 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 OR4C12Q96R67 309 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KLF12Q9Y4X4 402 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CYSRT1A8MQ03 144 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SNRPGP15A8MWD9 76 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FNDC10F2Z333 226 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NPFFO15130 113 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GALR1P47211 349 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SELENOPP49908 381 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DAPP51397 102 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 P2RX1P51575 399 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GPM6AP51674 278 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF345Q14585 488 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GINS1Q14691 196 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 Q6ZN92 141 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TMEM219Q86XT9 240 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 OR4K17Q8NGC6 315 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NEURL3Q96EH8 262 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TMEM204Q9BSN7 226 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MLST8Q9BVC4 326 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 VDAC3Q9Y277 283 aa4.98□□□□□ -1.61
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 C15orf61A6NNL5 157 aa4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms