RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 LTBRP36941 435 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM86BQ8N661 226 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 NRN1Q9NPD7 142 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 A6NNC1 897 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 C9JCJ5 164 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM50AO95807 157 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRM-202ENST00000400053 C1QTNF9P0C862 333 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 PCOLCEQ15113 449 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 JMJD8Q96S16 334 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRM-202ENST00000400053 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
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PTPRM-202ENST00000400053 ELOVL5Q9NYP7 299 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRM-202ENST00000400053 TRGV3P03979 118 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 CXCL1P09341 107 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 PLNP26678 52 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 FAM57AQ8TBR7 257 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 PEMTQ9UBM1 199 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 TIAF1O95411 115 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRM-202ENST00000400053 GPR183P32249 361 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 LINC01559Q495D7 138 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF525Q8N782 197 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 DUX3Q96PT4 197 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
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PTPRM-202ENST00000400053 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
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PTPRM-202ENST00000400053 MPDZO75970 2070 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 MALP21145 153 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 PYY3Q5JQD4 70 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 MUC21Q5SSG8 566 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRM-202ENST00000400053 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRM-202ENST00000400053 CD5P06127 495 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00271P0C7V0 271 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 COX6A1P12074 109 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 ORMDL3Q8N138 153 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 TM4SF5O14894 197 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 NAPSAO96009 420 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 MOSP00540 346 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF688P0C7X2 276 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 ASCL2Q99929 193 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 WFDC1Q9HC57 220 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRM-202ENST00000400053 M0R381 172 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRM-202ENST00000400053 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRM-202ENST00000400053 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 PPBPP02775 128 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 TBR1Q16650 682 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 RNF182Q8N6D2 247 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 IGFBP2P18065 325 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 ADMP35318 185 aa7.46□□□□□ -1.21
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