RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCUN1D4Q92564 292 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSPB7Q9UBY9 170 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEBPZOSA8MTT3 80 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM90A26D6RGX4 464 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 G3V4G9 280 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GGCTO75223 188 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PITX3O75364 302 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFNA21P01568 189 aa11.75□□□□□ -0.53
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MFAP2P55001 183 aa11.75□□□□□ -0.53
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPEL1Q2QD12 228 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BEAN1Q3B7T3 259 aa11.75□□□□□ -0.53
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 NOXA1Q86UR1 476 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DUSP18Q8NEJ0 188 aa11.75□□□□□ -0.53
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIPK2Q9H2X6 1198 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MFSD2BA6NFX1 497 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEC14L6B5MCN3 397 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BMPR1BO00238 502 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LY86O95711 162 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRBV12-3P01733 135 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPINK9Q5DT21 86 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1QL4Q86Z23 238 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR1S1Q8NH92 325 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TXN2Q99757 166 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ELOVL1Q9BW60 279 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C21orf62Q9NYP8 219 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV6A0A075B6T7 132 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 I3L2K1 104 aa11.73□□□□□ -0.53
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLEC3BP05452 202 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HOXB5P09067 269 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARL3P36405 182 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.73□□□□□ -0.53
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLEC19AQ6UXS0 136 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DTD1Q8TEA8 209 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCARB1Q8WTV0 552 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MISP3Q96FF7 219 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 U3KQ87 197 aa11.73□□□□□ -0.53
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C2orf83Q53S99 150 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACSM6Q6P461 480 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 REC114Q7Z4M0 266 aa11.72□□□□□ -0.53
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC24A4Q8NFF2 622 aa11.72□□□□□ -0.53
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PEMTQ9UBM1 199 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa11.71□□□□□ -0.53
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TGOLN2O43493 480 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MT-CO2P00403 227 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPR183P32249 361 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MFAP4P55083 255 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYNJ2BPP57105 145 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM106AQ4KMX7 169 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLET1Q6UQ28 207 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NRARPQ7Z6K4 114 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4C12Q96R67 309 aa11.71□□□□□ -0.53
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRAF2O60831 178 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAP1O75689 374 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV3-23P01764 117 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPY1RP25929 384 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPBWR1P48145 328 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR52B4Q8NGK2 314 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBKSQ9H477 322 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PALMDQ9NP74 551 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 S4R3C0 116 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SAP30O75446 220 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCGB2A1O75556 95 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NXPH3O95157 252 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2C1O95371 312 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPP30P78346 268 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q56UQ5 140 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MARVELD1Q9BSK0 173 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MGAM2Q2M2H8 2515 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VWFP04275 2813 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2T8A6NH00 312 aa11.68□□□□□ -0.54
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