RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373159.1

TRAPPC3-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-201ENST00000373159 VSIRQ9H7M9 311 aa9.53□□□□□ -0.88
TRAPPC3-201ENST00000373159 IFT46Q9NQC8 304 aa9.53□□□□□ -0.88
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TRAPPC3-201ENST00000373159 ANAPC10Q9UM13 185 aa9.53□□□□□ -0.88
TRAPPC3-201ENST00000373159 MEIS3P1A6NDR6 274 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 GPR31O00270 319 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 NAT1P18440 290 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 DEFB131AP59861 70 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 TOMM20LQ6UXN7 152 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 Q8NAQ8 132 aa9.52□□□□□ -0.89
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TRAPPC3-201ENST00000373159 ST8SIA2Q92186 375 aa9.52□□□□□ -0.89
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TRAPPC3-201ENST00000373159 ST8SIA3O43173 380 aa9.51□□□□□ -0.89
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TRAPPC3-201ENST00000373159 PVRIGQ6DKI7 326 aa9.48□□□□□ -0.89
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TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A1B0GU03 582 aa9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A1W2PS18 150 aa9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 INS-IGF2F8WCM5 200 aa9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 K7EQG2 157 aa9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPP1P10451 314 aa9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 NPPCP23582 126 aa9.47□□□□□ -0.89
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TRAPPC3-201ENST00000373159 UCP3P55916 312 aa9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 TAS2R20P59543 309 aa9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 UBE2NLQ5JXB2 153 aa9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 TMEM69Q5SWH9 247 aa9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 Q6ZTC4 211 aa9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 GRAMD2BQ96HH9 432 aa9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 RNF126Q9BV68 326 aa9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 RABAC1Q9UI14 185 aa9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 X6R8D5 127 aa9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 AGRNO00468 2067 aa9.46□□□□□ -0.89
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TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A1B0GVY2 172 aa9.46□□□□□ -0.9
TRAPPC3-201ENST00000373159 CRYBB3P26998 211 aa9.46□□□□□ -0.9
TRAPPC3-201ENST00000373159 HLA-DMAP28067 261 aa9.46□□□□□ -0.9
TRAPPC3-201ENST00000373159 SNCAP37840 140 aa9.46□□□□□ -0.9
TRAPPC3-201ENST00000373159 TSPAN5P62079 268 aa9.46□□□□□ -0.9
TRAPPC3-201ENST00000373159 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.46□□□□□ -0.9
TRAPPC3-201ENST00000373159 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.46□□□□□ -0.9
TRAPPC3-201ENST00000373159 MRGPRFQ96AM1 343 aa9.46□□□□□ -0.9
TRAPPC3-201ENST00000373159 MED14OSP0DP75 135 aa9.45□□□□□ -0.9
TRAPPC3-201ENST00000373159 RPS19P39019 145 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TRAPPC3-201ENST00000373159 SAMD12Q8N8I0 201 aa9.45□□□□□ -0.9
TRAPPC3-201ENST00000373159 GPX8Q8TED1 209 aa9.45□□□□□ -0.9
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