RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 CCL25O15444 150 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 OR2H2O95918 312 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 NGFP01138 241 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 APCSP02743 223 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 ADH4P08319 380 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 NPY1RP25929 384 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 TFPI2P48307 235 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 ARF1P84077 181 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 TDRG1Q3Y452 100 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 GAGE13Q4V321 117 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 KRTCAP3Q53RY4 240 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 VWA1Q6PCB0 445 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 OR8I2Q8N0Y5 310 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 STPG4Q8N801 248 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 Q8N976 141 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF114Q8NC26 417 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 POM121L2Q96KW2 1035 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 OR2V2Q96R30 315 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 GGTLC1Q9BX51 225 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 ST20Q9HBF5 79 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 C1RLQ9NZP8 487 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 IL36RNQ9UBH0 155 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 USP24Q9UPU5 2620 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 FASNP49327 2511 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1B0GUS0 222 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PRX2 142 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 IZUMO1RA6ND01 250 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFB8O95169 186 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 RFPL3SP0C7P2 107 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 C3orf79P0CE67 100 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 PMCHP20382 165 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 ERVK11-1P61568 191 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 RHOGP84095 191 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA46Q5T0L3 261 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 BATF2Q8N1L9 274 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 MUC15Q8N387 334 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM251Q8N6I4 163 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 Q8N7P7 452 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF439Q8NDP4 499 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 FGFBP3Q8TAT2 258 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 SMIM12Q96EX1 92 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 GCM1Q9NP62 436 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 IGLC7A0M8Q6 106 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 PINLYPA6NC86 204 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 FAM181BA6NEQ2 426 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 B5MCH6 92 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 RAMP3O60896 148 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 HAND1O96004 215 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 CA2P00918 260 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF83P51522 516 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 CLDN18P56856 261 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2G1P62253 170 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHA3Q9HB20 300 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 ENY2Q9NPA8 101 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 NCKAP5O14513 1909 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PRE2 83 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 H0YJW9 148 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 K7EN84 100 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 K7ENP7 123 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 IFNL4K9M1U5 179 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 SPINT2O43291 252 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 HLA-DRB1P01911 266 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 OR5AL1P0C617 328 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 SRIP30626 198 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 MAGEA5P43359 124 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 ARF6P62330 175 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 EFNB3Q15768 340 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 VAMP3Q15836 100 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 CENPWQ5EE01 88 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 TSKUQ8WUA8 353 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 MGST2Q99735 147 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 HES7Q9BYE0 225 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 M0R2Z0 102 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 SLC17A3O00476 420 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-201ENST00000372616 CRXO43186 299 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
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