RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 H2AFB1P0C5Y9 115 aa12.19□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 GCSAMLQ5JQS6 135 aa12.19□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 Q8N9W7 124 aa12.19□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 PIFOQ8TCI5 191 aa12.19□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 MBD6Q96DN6 1003 aa12.19□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 DMRT1Q9Y5R6 373 aa12.19□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV4-31P0DP07 118 aa12.18□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP12.18□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 CX3CL1P78423 397 aa12.18□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM41BQ5BJD5 291 aa12.18□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 MIC13Q5XKP0 118 aa12.18□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 ABHD5Q8WTS1 349 aa12.18□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 AKAP9Q99996 3911 aa12.18□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 NDPQ00604 133 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM249Q2WGJ8 235 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 TEPPQ6URK8 271 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 LCN15Q6UWW0 184 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 IL34Q6ZMJ4 242 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM219Q86XT9 240 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 MISP3Q96FF7 219 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 SCRT1Q9BWW7 348 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 GGTLC1Q9BX51 225 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 MEGF9Q9H1U4 602 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 C9JQL5 133 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 C17orf112F2Z3M2 114 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 YIF1AO95070 293 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 OPRK1P41145 380 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF562Q6V9R5 426 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 WFDC11Q8NEX6 87 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 OR10G4Q8NGN3 311 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 OR10G9Q8NGN4 311 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 OR10G7Q8NGN6 311 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 ACY3Q96HD9 319 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 SSX3Q99909 188 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 WNT10AQ9GZT5 417 aa12.17□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC168Q8NDH2 2452 aa12.16□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 FASNP49327 2511 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 GATA3P23771 443 aa12.16□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 ASPHD1Q5U4P2 390 aa12.16□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 DPPA3Q6W0C5 159 aa12.16□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 SLC16A13Q7RTY0 426 aa12.16□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM144Q7Z5S9 345 aa12.16□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A33Q9BSK2 321 aa12.16□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 TREM1Q9NP99 234 aa12.16□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 PXMP4Q9Y6I8 212 aa12.16□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa12.15□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 LINC01548A6NM66 108 aa12.15□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 NUDT19A8MXV4 375 aa12.15□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 MPDU1O75352 247 aa12.15□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 PVRIGQ6DKI7 326 aa12.15□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 FAM122CQ6P4D5 195 aa12.15□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 PRSS57Q6UWY2 283 aa12.15□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF114Q8NC26 417 aa12.15□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 C22orf15Q8WYQ4 148 aa12.15□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 RARRES2Q99969 163 aa12.15□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 HSPB9Q9BQS6 159 aa12.15□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 ITPR3Q14573 2671 aa12.15□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 FNDC10F2Z333 226 aa12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 LY6EQ16553 131 aa12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 GUK1Q16774 197 aa12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 OR1P1Q8NH06 330 aa12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 MBD3L1Q8WWY6 194 aa12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 CACNG8Q8WXS5 425 aa12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 NPIPB3Q92617 1050 aa12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 RASL11BQ9BPW5 248 aa12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 C1RLQ9NZP8 487 aa12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 CD5P06127 495 aa12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 LINC00869P0C866 280 aa12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 CTRB1P17538 263 aa12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 OR10J1P30954 320 aa12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 CTRB2Q6GPI1 263 aa12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 LFNGQ8NES3 379 aa12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 ARPC1AQ92747 370 aa12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A22Q9H936 323 aa12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 SLC39A9Q9NUM3 307 aa12.14□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 M6PRP20645 277 aa12.13□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 UQCC3Q6UW78 93 aa12.13□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 STPG3Q8N7X2 389 aa12.13□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 SLC35E1Q96K37 410 aa12.13□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa12.13□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 SLC45A2Q9UMX9 530 aa12.13□□□□□ -0.47
CASQ1-201ENST00000368078 MT-CO2P00403 227 aa12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms