RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 TCF23Q7RTU1 214 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 Q8N976 141 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM178BH3BS89 294 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 RAMP3O60896 148 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 OR5G3P0C626 314 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 IGLC2P0DOY2 106 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 IGLC3P0DOY3 106 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 PTTG1IPP53801 180 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 OR5B3Q8NH48 314 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF462Q96JM2 2506 aa15.24■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa15.24■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 A0A1W2PN81 502 aa15.24■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 C9JCJ5 164 aa15.24■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF253O75346 499 aa15.24■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 LGALS4P56470 323 aa15.24■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 BRWD1-AS2P59051 145 aa15.24■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 UBE2V1Q13404 147 aa15.24■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 SPATA45Q537H7 98 aa15.24■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 FAM216AQ8WUB2 273 aa15.24■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa15.24■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 C17orf98A8MV24 154 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 B9A039 149 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 CD1BP29016 333 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 GPR12P47775 334 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 ATP5G3P48201 142 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 TFF3Q07654 80 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 RAB9BQ9NP90 201 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 CLN8Q9UBY8 286 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 FBXL7Q9UJT9 491 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 WDR83OSQ9Y284 106 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 PPIAL4EA0A075B759 164 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 PPIAL4DF5H284 164 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 NDUFB8O95169 186 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 PPIAL4FP0DN26 164 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 MMDQ15546 238 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 OR1L6Q8NGR2 347 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 MS4A5Q9H3V2 200 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 PPIAL4AQ9Y536 164 aa15.23■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 A0A1W2PPV4 95 aa15.22■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 LINC00473A8K010 186 aa15.22■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 FCN1O00602 326 aa15.22■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 RAB29O14966 203 aa15.22■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 S1PR2O95136 353 aa15.22■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 CLDN14O95500 239 aa15.22■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 CBLN1P23435 193 aa15.22■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 TFPI2P48307 235 aa15.22■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 LINC00205P59089 165 aa15.22■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 RPS20P60866 119 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 UTF1Q5T230 341 aa15.22■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 C19orf35Q6ZS72 473 aa15.22■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 PNKDQ8N490 385 aa15.22■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF114Q8NC26 417 aa15.22■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF738Q8NE65 137 aa15.22■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 CCL17Q92583 94 aa15.22■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 KCNS1Q96KK3 526 aa15.22■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 PROP1O75360 226 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 HYPMO75409 117 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 CXorf1O96002 111 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 IGHV3-7P01780 117 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF134P52741 427 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 RPEL1Q2QD12 228 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 HLA-DRB5Q30154 266 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 STPG4Q8N801 248 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 CORO2AQ92828 525 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 C11orf52Q96A22 123 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 TXN2Q99757 166 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 IFI27L2Q9H2X8 130 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 NBASA2RRP1 2371 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-204ENST00000352260 CCL25O15444 150 aa15.21■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 CD33P20138 364 aa15.21■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 Q8N7P7 452 aa15.21■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 BET1LQ9NYM9 111 aa15.21■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 OR10J4P0C629 311 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 STAG3L2P0CL84 134 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 STAG3L3P0CL85 134 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 LOXP28300 417 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 DUTP33316 252 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 G6PCP35575 357 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 OPRK1P41145 380 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 PMCHL1Q16048 86 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 Q6ZN92 141 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 OCC1Q8TAD7 63 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 LEAP2Q969E1 77 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 DERL1Q9BUN8 251 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 LINC00574Q9H8X3 128 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 NRN1Q9NPD7 142 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-204ENST00000352260 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.8 ms