RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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PKHD1-201ENST00000340994 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 J3KRW8 73 aa7□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3-13P01766 116 aa7□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3-7P01780 117 aa7□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 FAM90A2PQ658T7 463 aa7□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 SPG11Q96JI7 2443 aa7□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa7□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 RFLNBQ8N5W9 214 aa7□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF815PA8K554 130 aa7□□□□□ -1.29
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PKHD1-201ENST00000340994 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.99□□□□□ -1.29
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PKHD1-201ENST00000340994 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.99□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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PKHD1-201ENST00000340994 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.99□□□□□ -1.29
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PKHD1-201ENST00000340994 GZMBP10144 247 aa6.98□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.98□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.98□□□□□ -1.29
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PKHD1-201ENST00000340994 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.98□□□□□ -1.29
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PKHD1-201ENST00000340994 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.98□□□□□ -1.29
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PKHD1-201ENST00000340994 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa6.98□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF415Q09FC8 603 aa6.98□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 SNAI2O43623 268 aa6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 APELAP0DMC3 54 aa6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 CEACAM1P13688 526 aa6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF525Q8N782 197 aa6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 NTN1O95631 604 aa6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 R4GN57 208 aa6.97□□□□□ -1.29
PKHD1-201ENST00000340994 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.97□□□□□ -1.29
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