RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 E7EUB6 86 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 J3QLI3 93 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 FCN1O00602 326 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 CYB5BO43169 146 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 TGFAP01135 160 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 FHITP49789 147 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 BPIFB3P59826 476 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 AKR1C1Q04828 323 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 WT1-ASQ06250 92 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 FXYD3Q14802 87 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 C17orf50Q8WW18 174 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 PBDC1Q9BVG4 233 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 CORTO00230 105 aa8.06□□□□□ -1.12
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RABGGTB-201ENST00000319942 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 Q5PR19 223 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 Q8N6K4 173 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1P1Q8NH06 330 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 ABHD5Q8WTS1 349 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 AJUBAQ96IF1 538 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC35E1Q96K37 410 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 P2RX4Q99571 388 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 RPRMQ9NS64 109 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 RFNGQ9Y644 331 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 TNCP24821 2201 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 CGB1A6NKQ9 187 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 AGPAT2O15120 278 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFA4P12838 97 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 M6PRP20645 277 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 PAX6P26367 422 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 OPRK1P41145 380 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 PEA15Q15121 130 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF114Q8NC26 417 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 SSMEM1Q8WWF3 244 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 COL12A1Q99715 3063 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPN13Q12923 2485 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A096LNT2 108 aa8.04□□□□□ -1.12
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RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GW64 132 aa8.04□□□□□ -1.12
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RABGGTB-201ENST00000319942 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 TREM1Q9NP99 234 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
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RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PPV4 95 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 TEX22C9J3V5 150 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 AREGP15514 252 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 BRD3OSQ6XYD6 125 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC16A13Q7RTY0 426 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 Q96MF0 132 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
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RABGGTB-201ENST00000319942 CHD6Q8TD26 2715 aa8.02□□□□□ -1.12
RABGGTB-201ENST00000319942 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 EREGO14944 169 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 HLA-DRB1P01911 266 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 REG1AP05451 166 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 B2MP61769 119 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 GUK1Q16774 197 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM249Q2WGJ8 235 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 TOR2AQ5JU69 321 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 CYB5R2Q6BCY4 276 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 ACSM6Q6P461 480 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 LCN15Q6UWW0 184 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.02□□□□□ -1.13
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