RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 MMDQ15546 238 aa21.45■■□□□ 1.02
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HOXD8-201ENST00000313173 MANBALQ9NQG1 85 aa21.45■■□□□ 1.02
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HOXD8-201ENST00000313173 SSX2Q16385 188 aa21.44■■□□□ 1.02
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HOXD8-201ENST00000313173 LINC00869P0C866 280 aa21.43■■□□□ 1.02
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HOXD8-201ENST00000313173 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
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HOXD8-201ENST00000313173 STAG3L3P0CL85 134 aa21.4■■□□□ 1.02
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HOXD8-201ENST00000313173 LPAR2Q9HBW0 351 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD8-201ENST00000313173 CXorf1O96002 111 aa21.37■■□□□ 1.01
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HOXD8-201ENST00000313173 APELAP0DMC3 54 aa21.37■■□□□ 1.01
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HOXD8-201ENST00000313173 Q8N6K4 173 aa21.37■■□□□ 1.01
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HOXD8-201ENST00000313173 MALSU1Q96EH3 234 aa21.37■■□□□ 1.01
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HOXD8-201ENST00000313173 MISP3Q96FF7 219 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD8-201ENST00000313173 SMCO4Q9NRQ5 59 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD8-201ENST00000313173 MED13LQ71F56 2210 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD8-201ENST00000313173 PAGE4O60829 102 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD8-201ENST00000313173 SPNS3Q6ZMD2 512 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD8-201ENST00000313173 NPIPB3Q92617 1050 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD8-201ENST00000313173 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD8-201ENST00000313173 TVP23CQ96ET8 276 aa21.35■■□□□ 1.01
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