RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.05□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.05□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.05□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 ORM2P19652 201 aa7.04□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.04□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 NPIPB3Q92617 1050 aa7.04□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.04□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 CTSZQ9UBR2 303 aa7.04□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 PPIAL4AQ9Y536 164 aa7.04□□□□□ -1.28
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GINS1-201ENST00000262460 CXorf1O96002 111 aa7.04□□□□□ -1.28
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GINS1-201ENST00000262460 FAM87AP0C7U9 286 aa7.04□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 IRF2P14316 349 aa7.04□□□□□ -1.28
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GINS1-201ENST00000262460 ATOH7Q8N100 152 aa7.04□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.04□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.04□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 LINC01560Q8TB33 94 aa7.04□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.04□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 SAP30LQ9HAJ7 183 aa7.04□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 CORTO00230 105 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 FCN1O00602 326 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 SERF1AO75920 110 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 OR5G3P0C626 314 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 COX7A1P24310 79 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 BATFQ16520 125 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 OR1L6Q8NGR2 347 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 SNURFLB1AK76 121 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 G0S2P27469 103 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 SELENOVP59797 346 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 RANP62826 216 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 PAX5Q02548 391 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 IQCJQ1A5X6 159 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 RCHY1Q96PM5 261 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 PDE6DO43924 150 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 AREGP15514 252 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 RHOBP62745 196 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 COMMD5Q9GZQ3 224 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS1-201ENST00000262460 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
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GINS1-201ENST00000262460 HELTA6NFD8 242 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 CGB1A6NKQ9 187 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 M0QZ24 198 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 UPK2O00526 184 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 MMD2Q8IY49 270 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
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GINS1-201ENST00000262460 TSTD3H0UI37 97 aa7.02□□□□□ -1.29
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GINS1-201ENST00000262460 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 GNG4P50150 75 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 TCF15Q12870 199 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 FOXC1Q12948 553 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 Q6ZS92 163 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 Q6ZWC4 215 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 BAGE3Q86Y29 109 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 BAGE2Q86Y30 109 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 PRSS33Q8NF86 280 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 MS4A10Q96PG2 267 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 ITPR1Q14643 2758 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 PRR20EP86478 221 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 PRR20CP86479 221 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 PRR20DP86480 221 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 PRR20BP86481 221 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 PRR20AP86496 221 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 CDSNQ15517 529 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 GFRALQ6UXV0 394 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.01□□□□□ -1.29
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