RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 CBLN1P23435 193 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 ADTRPQ96IZ2 230 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 NABP2Q9BQ15 211 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1B0GV90 55 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 C9JCJ5 164 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 FNDC10F2Z333 226 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 MORN5Q5VZ52 161 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 CHODLQ9H9P2 273 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 PLEKHA3Q9HB20 300 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 PRNDQ9UKY0 176 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 V9GYV3 84 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 GGTLC3B5MD39 225 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 AREGP15514 252 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 OR9G1Q8NH87 305 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM18Q96B42 140 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 ENY2Q9NPA8 101 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 SLC35D1Q9NTN3 355 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 IL36BQ9NZH7 164 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 A8MXE2 369 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 RAB4BP61018 213 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 CCL8P80075 99 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF600Q6ZNG1 722 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 PSMB11A5LHX3 300 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 CGB1A6NKQ9 187 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 CCL3L1P16619 93 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 LGALS4P56470 323 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 PSG5Q15238 335 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 SFXN3Q9BWM7 321 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 F2Z2F3 143 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 OR10J1P30954 320 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 KRTCAP3Q53RY4 240 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 C2orf83Q53S99 150 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 NAV3Q8IVL0 2385 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 CRYBB3P26998 211 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 SELENOTP62341 195 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 CENPWQ5EE01 88 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 BET1LQ9NYM9 111 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 IGLV2-8P01709 118 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 OR5G3P0C626 314 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00312Q9Y6C7 94 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
C9orf170-201ENST00000623052 H0YJW9 148 aa10.83□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 OR10J4P0C629 311 aa10.83□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 CD33P20138 364 aa10.83□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 ASPHD1Q5U4P2 390 aa10.83□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 NUP37Q8NFH4 326 aa10.83□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 RAB9BQ9NP90 201 aa10.83□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 LY96Q9Y6Y9 160 aa10.83□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 NDUFB7P17568 137 aa10.83□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 CHRNB4P30926 498 aa10.83□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 REG1BP48304 166 aa10.83□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 ADIPOQQ15848 244 aa10.83□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 RTL8BQ17RB0 113 aa10.83□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa10.83□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF90Q03938 601 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 RAB31Q13636 194 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 DOLPP1Q86YN1 238 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 OR1L8Q8NGR8 309 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 OR2T6Q8NHC8 308 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 FAM57AQ8TBR7 257 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 MISP3Q96FF7 219 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 TRAV5A0A0B4J249 113 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 RNF224P0DH78 156 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 SLC25A2Q9BXI2 301 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 A0A0G2JNJ9 132 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 DPRXA6NFQ7 191 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 THBDP07204 575 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 CD69Q07108 199 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 C10orf55Q5SWW7 151 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM200BQ69YZ2 307 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 PQLC2Q6ZP29 291 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 Q6ZWC4 215 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 MMD2Q8IY49 270 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 SLC35E1Q96K37 410 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 NDUFAF3Q9BU61 184 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 Q9UFV3 132 aa10.82□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa10.81□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 OR5AN1Q8NGI8 311 aa10.81□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 OR1L6Q8NGR2 347 aa10.81□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 OR5B3Q8NH48 314 aa10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms