RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609284.1

NUP50-AS1-203, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NUP50-AS1, Length 710 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HINT2Q9BX68 163 aa7.18□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TEX22C9J3V5 150 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FNDC10F2Z333 226 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FGF16O43320 207 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IFNA5P01569 189 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OPN1MWP04001 364 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SEC11BP0C7V7 166 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OPN1MW2P0DN77 364 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SPP1P10451 314 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CD24P25063 80 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ERHP84090 104 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 WT1-ASQ06250 92 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HNF4GQ14541 408 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NDUFA5Q16718 116 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NANPQ8TBE9 248 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TMED6Q8WW62 240 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.17□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 E7EUB6 86 aa7.16□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TSPAN9O75954 239 aa7.16□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RAB14P61106 215 aa7.16□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GNB1P62873 340 aa7.16□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.16□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.16□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 Q8N9W7 124 aa7.16□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa7.16□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.16□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ARPC1AQ92747 370 aa7.16□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.16□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.16□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HIVEP1P15822 2718 aa7.16□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.16□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 A6NDX4 124 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CORTO00230 105 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CD5LO43866 347 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MPDU1O75352 247 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IFNA4P05014 189 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NMBP08949 121 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OR13C7P0DN81 318 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MDKP21741 143 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ATP6V0CP27449 155 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SNCAP37840 140 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SULT1A2P50226 295 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NDPQ00604 133 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OR1P1Q8NH06 330 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PIFOQ8TCI5 191 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 P2RX4Q99571 388 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SSX3Q99909 188 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
NUP50-AS1-203ENST00000609284 AKAP9Q99996 3911 aa7.15□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NPIPB5A8MRT5 1133 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 UMAD1C9J7I0 102 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 H3BUX3 64 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRIM77I1YAP6 450 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 M0QZK8 103 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FCN1O00602 326 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SOX15O60248 233 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CNIH1O95406 144 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 AREGP15514 252 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ACANP16112 2415 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FGF7P21781 194 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RAB5CP51148 216 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CX3CL1P78423 397 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RUNX1Q01196 453 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CD69Q07108 199 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FXYD3Q14802 87 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OR1L6Q8NGR2 347 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OR2G3Q8NGZ4 309 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OR5R1Q8NH85 324 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ABHD5Q8WTS1 349 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RNF141Q8WVD5 230 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms