RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 ZXDAP98168 799 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-242ENST00000602319 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-242ENST00000602319 OR2V2Q96R30 315 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-242ENST00000602319 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-242ENST00000602319 SPINK4O60575 86 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-242ENST00000602319 GPR12P47775 334 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-242ENST00000602319 FAM173AQ9BQD7 235 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-242ENST00000602319 METRNQ9UJH8 293 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-242ENST00000602319 LOXL2Q9Y4K0 774 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-242ENST00000602319 FREM1Q5H8C1 2179 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-242ENST00000602319 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.09□□□□□ -1.11
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HCG18-242ENST00000602319 CD5LO43866 347 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-242ENST00000602319 NTF3P20783 257 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-242ENST00000602319 MYCNOSP40205 109 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-242ENST00000602319 BPIFB3P59826 476 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-242ENST00000602319 ERVK-16P61578 105 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-242ENST00000602319 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
HCG18-242ENST00000602319 ALKBH6Q3KRA9 238 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-242ENST00000602319 FAM71F2Q6NXP2 309 aa8.09□□□□□ -1.11
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HCG18-242ENST00000602319 CYB561P49447 251 aa8.08□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 SLC35B1P78383 322 aa8.08□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 Q56UQ5 140 aa8.08□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 WDR82Q6UXN9 313 aa8.08□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
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HCG18-242ENST00000602319 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.08□□□□□ -1.12
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HCG18-242ENST00000602319 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.08□□□□□ -1.12
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HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.08□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 TAS2R45P59539 299 aa8.08□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 MPV17L2Q567V2 206 aa8.08□□□□□ -1.12
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HCG18-242ENST00000602319 OR4A47Q6IF82 309 aa8.07□□□□□ -1.12
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HCG18-242ENST00000602319 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.07□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 NUDT11Q96G61 164 aa8.07□□□□□ -1.12
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HCG18-242ENST00000602319 ZNF134P52741 427 aa8.06□□□□□ -1.12
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HCG18-242ENST00000602319 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.06□□□□□ -1.12
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HCG18-242ENST00000602319 M0R1X1 148 aa8.06□□□□□ -1.12
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HCG18-242ENST00000602319 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 GATD1Q8NB37 220 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 TRIB1Q96RU8 372 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 S1PR3Q99500 378 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
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