RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 HIST3H3Q16695 136 aa9.25□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa9.25□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 OR51G1Q8NGK1 321 aa9.25□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 RASD2Q96D21 266 aa9.25□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 NMNAT3Q96T66 252 aa9.25□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 VAMP8Q9BV40 100 aa9.25□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 HHLA2Q9UM44 414 aa9.25□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 A6NDX4 124 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 K7ERU9 68 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 PLPP3O14495 311 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 MSR1P21757 451 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 TUBG1P23258 451 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 UCP1P25874 307 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 BLCAPP62952 87 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 BAXQ07812 192 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 PCK2Q16822 640 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 C10orf99Q6UWK7 81 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 TOMM20LQ6UXN7 152 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 LRRC75AQ8NAA5 344 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 OR5L1Q8NGL2 311 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 OR4D5Q8NGN0 318 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 OR10AC1Q8NH08 325 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 OTOSQ8NHW6 89 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 ZNRF4Q8WWF5 429 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 OR2H1Q9GZK4 316 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 TUBG2Q9NRH3 451 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 KAAG1Q9UBP8 84 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 AK3Q9UIJ7 227 aa9.24□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 ST8SIA3O43173 380 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 NDUFB8O95169 186 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 RENP00797 406 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 REG1AP05451 166 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 CTXN2P0C2S0 81 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 OR5G3P0C626 314 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 DUSP1P28562 367 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 PSG3Q16557 428 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 C10orf128Q5T292 105 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 KCNIP4Q6PIL6 250 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 COMMD2Q86X83 199 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 OR5AS1Q8N127 324 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 OR4X2Q8NGF9 303 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 ABHD6Q9BV23 337 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 BET1LQ9NYM9 111 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 TAS2R4Q9NYW5 299 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 RPH3ALQ9UNE2 315 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 DNAH6Q9C0G6 4158 aa9.23□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 BCL2P10415 239 aa9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 ATP6V0CP27449 155 aa9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 CCL20P78556 96 aa9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 GNMTQ14749 295 aa9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 SLC18B1Q6NT16 456 aa9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 CFAP161Q6P656 301 aa9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 TMEM219Q86XT9 240 aa9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 FAM90A1Q86YD7 464 aa9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 GVQW1Q8N7I0 195 aa9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 CHST4Q8NCG5 386 aa9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 OR13G1Q8NGZ3 307 aa9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 OR2T10Q8NGZ9 312 aa9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 RNF2Q99496 336 aa9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 VPS25Q9BRG1 176 aa9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 SMIM3Q9BZL3 60 aa9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 HSF4Q9ULV5 492 aa9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HCG18-241ENST00000602290 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa9.21□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 OOEPA6NGQ2 149 aa9.21□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 TMEM250H0YL14 139 aa9.21□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 H7BYZ3 331 aa9.21□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 J3QR06 171 aa9.21□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 CDS2O95674 445 aa9.21□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 LY6G6CO95867 125 aa9.21□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 GYPAP02724 150 aa9.21□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 MYCNOSP40205 109 aa9.21□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 CTRLP40313 264 aa9.21□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 GALR1P47211 349 aa9.21□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 FHITP49789 147 aa9.21□□□□□ -0.94
HCG18-241ENST00000602290 SRPXP78539 464 aa9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms