RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598960.5

FCHO1-227, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF114Q8NC26 417 aa11.24□□□□□ -0.61
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FCHO1-227ENST00000598960 SH3BGRL3Q9H299 93 aa11.24□□□□□ -0.61
FCHO1-227ENST00000598960 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
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FCHO1-227ENST00000598960 SSX3Q99909 188 aa11.23□□□□□ -0.61
FCHO1-227ENST00000598960 SLC25A33Q9BSK2 321 aa11.23□□□□□ -0.61
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FCHO1-227ENST00000598960 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa11.23□□□□□ -0.61
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FCHO1-227ENST00000598960 FNDC10F2Z333 226 aa11.22□□□□□ -0.61
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FCHO1-227ENST00000598960 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
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FCHO1-227ENST00000598960 P2RX4Q99571 388 aa11.22□□□□□ -0.61
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FCHO1-227ENST00000598960 FAM157CP0CG43 387 aa11.21□□□□□ -0.61
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FCHO1-227ENST00000598960 CX3CL1P78423 397 aa11.21□□□□□ -0.61
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FCHO1-227ENST00000598960 ZNF562Q6V9R5 426 aa11.21□□□□□ -0.61
FCHO1-227ENST00000598960 C5orf56Q8N8D9 126 aa11.21□□□□□ -0.61
FCHO1-227ENST00000598960 OR2G3Q8NGZ4 309 aa11.21□□□□□ -0.61
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FCHO1-227ENST00000598960 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.61
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FCHO1-227ENST00000598960 C19orf35Q6ZS72 473 aa11.19□□□□□ -0.62
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FCHO1-227ENST00000598960 MPDU1O75352 247 aa11.18□□□□□ -0.62
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FCHO1-227ENST00000598960 AKR1C1Q04828 323 aa11.18□□□□□ -0.62
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FCHO1-227ENST00000598960 ASPHD1Q5U4P2 390 aa11.18□□□□□ -0.62
FCHO1-227ENST00000598960 CTRB2Q6GPI1 263 aa11.18□□□□□ -0.62
FCHO1-227ENST00000598960 C16orf82Q7Z2V1 217 aa11.18□□□□□ -0.62
FCHO1-227ENST00000598960 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
FCHO1-227ENST00000598960 CACNG8Q8WXS5 425 aa11.18□□□□□ -0.62
FCHO1-227ENST00000598960 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
FCHO1-227ENST00000598960 SLC35E1Q96K37 410 aa11.18□□□□□ -0.62
FCHO1-227ENST00000598960 NPCDR1Q9BY65 106 aa11.18□□□□□ -0.62
FCHO1-227ENST00000598960 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
FCHO1-227ENST00000598960 PITPNC1Q9UKF7 332 aa11.18□□□□□ -0.62
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