RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590499.1

SMAD4-211, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-211ENST00000590499 CCDC140Q96MF4 163 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD4-211ENST00000590499 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.54□□□□□ -1.04
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SMAD4-211ENST00000590499 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD4-211ENST00000590499 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD4-211ENST00000590499 C15orf61A6NNL5 157 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD4-211ENST00000590499 H0Y980 276 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD4-211ENST00000590499 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SMAD4-211ENST00000590499 DHFRP00374 187 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD4-211ENST00000590499 P0C879 139 aa8.53□□□□□ -1.04
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SMAD4-211ENST00000590499 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.53□□□□□ -1.04
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SMAD4-211ENST00000590499 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
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SMAD4-211ENST00000590499 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.52□□□□□ -1.05
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SMAD4-211ENST00000590499 FABP12A6NFH5 140 aa8.51□□□□□ -1.05
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SMAD4-211ENST00000590499 CCDC190Q86UF4 302 aa8.5□□□□□ -1.05
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SMAD4-211ENST00000590499 GPR132Q9UNW8 380 aa8.5□□□□□ -1.05
SMAD4-211ENST00000590499 TENM3Q9P273 2699 aa8.5□□□□□ -1.05
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SMAD4-211ENST00000590499 OR2C1O95371 312 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD4-211ENST00000590499 ARL3P36405 182 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD4-211ENST00000590499 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMAD4-211ENST00000590499 CD69Q07108 199 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD4-211ENST00000590499 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SMAD4-211ENST00000590499 SP6Q3SY56 376 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD4-211ENST00000590499 OR2C3Q8N628 320 aa8.49□□□□□ -1.05
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