RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAPPC2P0DI81 140 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAPPC2BP0DI82 140 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 PRCDQ00LT1 54 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 ARL16Q0P5N6 197 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF329Q86UD4 541 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 AKAP14Q86UN6 197 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 HAPLN4Q86UW8 402 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 C11orf44Q8N8P7 122 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OR1L8Q8NGR8 309 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OR4A5Q8NH83 315 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 VSTM2AQ8TAG5 236 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 MS4A10Q96PG2 267 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 SPIN2AQ99865 258 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF5Q99942 180 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 SMIM3Q9BZL3 60 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHA3Q9HB20 300 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 HSPB7Q9UBY9 170 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 PITPNC1Q9UKF7 332 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 PRNDQ9UKY0 176 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 DMRT1Q9Y5R6 373 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 POMT1Q9Y6A1 747 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 FN1P02751 2386 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV41A0A0B4J266 112 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PN81 502 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 C15orf62A8K5M9 175 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM77I1YAP6 450 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 L7N2F9 121 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 FGF16O43320 207 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TCF21O43680 179 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 PFDN1O60925 122 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 ACTL6BO94805 426 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHG2P01859 326 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 FGF2P09038 288 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 METTL15P1P0C7V9 234 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 MDKP21741 143 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMB6P28072 239 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 CHRNA7P36544 502 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 SPCS3P61009 180 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 RAP2BP61225 183 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 VAMP2P63027 116 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 SPANXN5Q5MJ07 72 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OR8H1Q8NGG4 311 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 DTD1Q8TEA8 209 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 DCUN1D4Q92564 292 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 NMES1Q9C002 83 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 COA4Q9NYJ1 87 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 PSENENQ9NZ42 101 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 SONP18583 2426 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ARPC5O15511 151 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXO24O75426 580 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 DEDDO75618 318 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2J3O76001 311 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CST7O76096 145 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFB8O95169 186 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 IFNA10P01566 189 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 HKR1P10072 659 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A6P12236 298 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CXCL2P19875 107 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 MAS1LP35410 378 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 CAV2P51636 162 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP10-3P60369 221 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 NHLH2Q02577 135 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 AARDQ4LEZ3 155 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 C19orf54Q5BKX5 351 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 OR8G2PQ6IF36 304 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A24Q6NUK1 477 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 PRSS54Q6PEW0 395 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF562Q6V9R5 426 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 C16orf82Q7Z2V1 217 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF429Q86V71 674 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 STPG2Q8N412 459 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2C3Q8N628 320 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM86BQ8N661 226 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM217Q8N7C4 229 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC24A4Q8NFF2 622 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5B3Q8NH48 314 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 SGMS2Q8NHU3 365 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5B12Q96R08 314 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 P2RX4Q99571 388 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 AIFM2Q9BRQ8 373 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-208ENST00000589162 PRSS22Q9GZN4 317 aa4.71□□□□□ -1.66
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