RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 MSGN1A6NI15 193 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 LY86O95711 162 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 OR5AC1P0C628 307 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 OR9G9P0C7N8 305 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 SPNP16150 400 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 S100GP29377 79 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 ASAH1Q13510 395 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 BSXQ3C1V8 233 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM128Q5BJH2 165 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 Q6ZRM9 215 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC25A42Q86VD7 318 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM219AQ8IW50 185 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF114Q8NC26 417 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 TSC22D3Q99576 134 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 COA4Q9NYJ1 87 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 COPZ2Q9P299 210 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 TENM3Q9P273 2699 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A0B4J2A0 478 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A0G2JLM5 398 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 ANKRD34BA5PLL1 514 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 PITX3O75364 302 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 UPK1BO75841 260 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 KRASP01116 189 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 APELAP0DMC3 54 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 MYOD1P15172 320 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 PGAM2P15259 253 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 AREGP15514 252 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 PSMB6P28072 239 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 G6PCP35575 357 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 WT1-ASQ06250 92 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 TNXAQ16473 311 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 TRIQKQ629K1 86 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF343Q6P1L6 599 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 OR52E5Q8NH55 327 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 OR4C12Q96R67 309 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 ATP6V0BQ99437 205 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 PHB2Q99623 299 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 PRNDQ9UKY0 176 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 STAB2Q8WWQ8 2551 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 HMX3A6NHT5 357 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM223BA6NKX1 122 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 LYRM1O43325 122 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 SERPINE2P07093 398 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC25A6P12236 298 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 GP9P14770 177 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 ZP3P21754 424 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 CCR6P51684 374 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 MFAP2P55001 183 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 ERVK-16P61578 105 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 SRPXP78539 464 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 PRCDQ00LT1 54 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 DEFA5Q01523 94 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 PPP1R1AQ13522 171 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF846Q147U1 533 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 SP6Q3SY56 376 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 SSX9Q7RTT3 188 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM223AQ8IWN6 122 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 OR2C3Q8N628 320 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 NECAP1Q8NC96 275 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 DUSP18Q8NEJ0 188 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 USMG5Q96IX5 58 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 ASCL2Q99929 193 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 MCUBQ9NWR8 336 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 FKBP11Q9NYL4 201 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 U3KQK5 164 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa5.23□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 F8W735 103 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 ACTL6BO94805 426 aa5.23□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 ATG12O94817 140 aa5.23□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 SFT2D2O95562 160 aa5.23□□□□□ -1.57
EFTUD2-210ENST00000588340 IGLV1-51P01701 117 aa5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms