RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581536.5

TOP3A-211, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 766 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-211ENST00000581536 TM4SF20Q53R12 229 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 STEAP1BQ6NZ63 245 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 GPHB5Q86YW7 130 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 TERB2Q8NHR7 220 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 RAB2BQ8WUD1 216 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 PEMTQ9UBM1 199 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 U3KQK5 164 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 H0Y980 276 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 TPPPO94811 219 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 DHFRP00374 187 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 IGKV1-5P01602 117 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 CBLN1P23435 193 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 GPR183P32249 361 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 TNFSF8P32971 234 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 TAS2R19P59542 299 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 RND3P61587 244 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 IL18Q14116 193 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 SPINK9Q5DT21 86 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 CADM3Q8N126 398 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 GDPD1Q8N9F7 314 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 OR13C8Q8NGS7 320 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 OR4A16Q8NH70 328 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 ISOC1Q96CN7 298 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 SOSTQ9BQB4 213 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 A0A0B4J293 547 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM213A2RRL7 107 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 OR2T8A6NH00 312 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 C15orf61A6NNL5 157 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 LGALS9O00182 355 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 IGHV3-48P01763 117 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 FGF2P09038 288 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 CD7P09564 240 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 MED14OSP0DP75 135 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 S100GP29377 79 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 FAM209BQ5JX69 171 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 Q6ZRM9 215 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 OR4C16Q8NGL9 310 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF414Q96IQ9 312 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 CXorf58Q96LI9 332 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 CHRDL1Q9BU40 450 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 FKBP11Q9NYL4 201 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 MLXQ9UH92 298 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 PRNDQ9UKY0 176 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 A0A0G2JRQ6 117 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 FABP12A6NFH5 140 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 K7EIM0 57 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 CTDSPLO15194 276 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 P0C879 139 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 PLET1Q6UQ28 207 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 Q8N402 240 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 ARRDC1Q8N5I2 433 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 DEFB125Q8N687 156 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 MCFD2Q8NI22 146 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 LHFPL5Q8TAF8 219 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM56Q96MV1 263 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 THYN1Q9P016 225 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 COPZ2Q9P299 210 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 A8MZ25 164 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 I3L2K1 104 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 ST8SIA3O43173 380 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 TGOLN2O43493 480 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 TBPP20226 339 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms