RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00473A8K010 186 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 C11orf94C9JXX5 98 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 DEFB4AO15263 64 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 FABP7O15540 132 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 S1PR2O95136 353 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 CTXN2P0C2S0 81 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 DEFA4P12838 97 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 CELP19835 753 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 RAB11AP62491 216 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 QRFPP83859 136 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 RAB11BQ15907 218 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 PLET1Q6UQ28 207 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 OR4A5Q8NH83 315 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 NUDT11Q96G61 164 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 CXorf58Q96LI9 332 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 PECRQ9BY49 303 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 FCGR3BO75015 233 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 CD1AP06126 327 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 GPR183P32249 361 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 ADMP35318 185 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM50BP56557 158 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 TIRAPP58753 221 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 SMCO1Q147U7 214 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF485Q8NCK3 441 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 GINS4Q9BRT9 223 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 OR51E2Q9H255 320 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 HSPG2P98160 4391 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 CBY3A6NI87 242 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 E7EUB6 86 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 M0R2N4 97 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 RTL8CO15255 209 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 MAS1LP35410 378 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 RASSF2P50749 326 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 ARFRP1Q13795 201 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 INSL4Q14641 139 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 P2RY14Q15391 338 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 OR2A7Q96R45 310 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 HINT2Q9BX68 163 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 MUC4Q99102 2169 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1B0GW64 132 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 MARCH11A6NNE9 402 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 MYL12BO14950 172 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 TGOLN2O43493 480 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 KBTBD11O94819 623 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 REG1AP05451 166 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 CRHBPP24387 322 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM187Q14656 261 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 KLK9Q2XQG4 91 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 J3QRK9 145 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 RAB27BO00194 218 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 CDK1P06493 297 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 FCGR3AP08637 254 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 P0DMU3 169 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 FAM231AP0DMU4 169 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 FAM231CP0DMU5 169 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 HLA-DMBP28068 263 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 TFPI2P48307 235 aa6.65□□□□□ -1.34
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