RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 CARD19Q96LW7 228 aa2.51□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 PEBP4Q96S96 227 aa2.51□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 PYGO2Q9BRQ0 406 aa2.51□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 CHCHD7Q9BUK0 85 aa2.51□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 ZNF286AQ9HBT8 521 aa2.51□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 TNFSF18Q9UNG2 199 aa2.51□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 ZFP30Q9Y2G7 519 aa2.51□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 NUP210LQ5VU65 1888 aa2.51□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa2.51□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 BCL9LQ86UU0 1499 aa2.51□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 ATAD5Q96QE3 1844 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 KIAA1671Q9BY89 1806 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 I3L521 148 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 K7ERS5 55 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 TAX1BP3O14907 124 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 CST7O76096 145 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 INSP01308 110 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 APCSP02743 223 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 INAFM2P0DMQ5 153 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 ZNF32P17041 273 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 SDC2P34741 201 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 PKIAP61925 76 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 CCL20P78556 96 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 BSPH1Q075Z2 132 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 Q1RN00 199 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 TEX261Q6UWH6 196 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 LINC01551Q86U37 167 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 CTAGE3PQ8IX95 158 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 SUMF2Q8NBJ7 301 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 OR4S1Q8NGB4 309 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 OR2T10Q8NGZ9 312 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 MAL2Q969L2 176 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 DEFB126Q9BYW3 111 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 FANCMQ8IYD8 2048 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 SCN2AQ99250 2005 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 NCAPD3P42695 1498 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 NCKAP5O14513 1909 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 DENND4CQ5VZ89 1909 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 M0R143 59 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 NCR2O95944 276 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 IGKV1-5P01602 117 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 IGKV1D-12P01611 117 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 APODP05090 189 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 SRP14P37108 136 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 CSN1S1P47710 185 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 RPL30P62888 115 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 RELAQ04206 551 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 LUZP6Q538Z0 58 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 Q5XG85 94 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 AMTNQ6UX39 209 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 SSX8Q7RTT4 187 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 PCP2Q8IVA1 136 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 MSRB3Q8IXL7 192 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 RNF175Q8N4F7 328 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 Q8N7P7 452 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 C16orf74Q96GX8 76 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 LINC00479Q96M42 142 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 CST9LQ9H4G1 147 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 OTORQ9NRC9 128 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 FAIMQ9NVQ4 179 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 FUT9Q9Y231 359 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 GRIN2AQ12879 1464 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 DOCK4Q8N1I0 1966 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 TMEM2Q9UHN6 1383 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa2.48□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 ATG2BQ96BY7 2078 aa2.48□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa2.48□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa2.48□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 A0A1B0GVX0 72 aa2.48□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 A0A1W2PP18 115 aa2.48□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 GGT3PA6NGU5 568 aa2.48□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 TMEM212A6NML5 194 aa2.48□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 LEUTXA8MZ59 168 aa2.48□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 C1orf196B1AJZ1 125 aa2.48□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 GGTLC3B5MD39 225 aa2.48□□□□□ -2.01
CS-232ENST00000552331 NPFFO15130 113 aa2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms