RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552295.5

BEST3-211, Transcript of bestrophin 3, humanhuman

TSL 5

Gene BEST3, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3-211ENST00000552295 E7EUB6 86 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 H0YIZ8 118 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 K7EPK0 472 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 FCN1O00602 326 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 PLXNB1O43157 2135 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 FGF16O43320 207 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 MPC2O95563 127 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 CA2P00918 260 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 AMY1AP04745 511 aa6.36□□□□□ -1.39
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BEST3-211ENST00000552295 PSMB6P28072 239 aa6.36□□□□□ -1.39
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BEST3-211ENST00000552295 S100A10P60903 97 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 SPCS3P61009 180 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 NHLH2Q02577 135 aa6.36□□□□□ -1.39
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BEST3-211ENST00000552295 TNXAQ16473 311 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.36□□□□□ -1.39
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BEST3-211ENST00000552295 OR52E5Q8NH55 327 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 CLCC1Q96S66 551 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 RNF126Q9BV68 326 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 RBKSQ9H477 322 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.36□□□□□ -1.39
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BEST3-211ENST00000552295 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.36□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 A0A1B0GW64 132 aa6.35□□□□□ -1.39
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BEST3-211ENST00000552295 SYNGR2O43760 224 aa6.35□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 SSSCA1O60232 199 aa6.35□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 DEDDO75618 318 aa6.35□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 TMEM50AO95807 157 aa6.35□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 IFNA17P01571 189 aa6.35□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 HLA-DRB1P01911 266 aa6.35□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 C1QBP02746 253 aa6.35□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 OPN1MWP04001 364 aa6.35□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.35□□□□□ -1.39
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BEST3-211ENST00000552295 PF4V1P10720 104 aa6.35□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 LYL1P12980 280 aa6.35□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 BLOC1S1P78537 153 aa6.35□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 PRCDQ00LT1 54 aa6.35□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 FGL1Q08830 312 aa6.35□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 SCGB2A2Q13296 93 aa6.35□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 SPINK9Q5DT21 86 aa6.35□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.35□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.35□□□□□ -1.39
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BEST3-211ENST00000552295 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 TEX22C9J3V5 150 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 M0QZK8 103 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 WRBO00258 174 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 MED6O75586 246 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 PET100P0DJ07 73 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 IAPPP10997 89 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 SLC25A4P12235 298 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 PAX9P55771 341 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 GNB1P62873 340 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 CX3CL1P78423 397 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 NDPQ00604 133 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 FOXI1Q12951 378 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 FXYD3Q14802 87 aa6.34□□□□□ -1.39
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BEST3-211ENST00000552295 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 TMEM86BQ8N661 226 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 THAP6Q8TBB0 222 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 DTD1Q8TEA8 209 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 RAB40CQ96S21 281 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 ESM1Q9NQ30 184 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.34□□□□□ -1.39
BEST3-211ENST00000552295 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.33□□□□□ -1.4
BEST3-211ENST00000552295 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.33□□□□□ -1.4
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