RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 OR5B3Q8NH48 314 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 TMEM190Q8WZ59 177 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 SEC22AQ96IW7 307 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 TMEM56Q96MV1 263 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 TSC22D3Q99576 134 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 CHRDL1Q9BU40 450 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 C5orf66Q9H5L9 145 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 TMEM14BQ9NUH8 114 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 C21orf62Q9NYP8 219 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 C15orf61A6NNL5 157 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 NDUFA4O00483 81 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 RCVRNP35243 200 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 ADMP35318 185 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 SPSB3Q6PJ21 355 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 OR2C3Q8N628 320 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 OR1L6Q8NGR2 347 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 ZNF414Q96IQ9 312 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 TSPAN4O14817 238 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 S100GP29377 79 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 RORCP51449 518 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 SLC38A6Q8IZM9 456 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 OR1P1Q8NH06 330 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 IL17DQ8TAD2 202 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 GGTLC1Q9BX51 225 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 K7EMT4 169 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 CTSGP08311 255 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 Q56UQ5 140 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 UBAC2Q8NBM4 344 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 OR4A16Q8NH70 328 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 OVOL2Q9BRP0 275 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 KLK11Q9UBX7 282 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-229ENST00000551936 FAM25AB3EWG3 89 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 FAM25CB3EWG5 89 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 FAM25GB3EWG6 89 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 I3L2K1 104 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 M0QYG6 137 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 PRCDQ00LT1 54 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 CTF1Q16619 201 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 MZT2AQ6P582 158 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 LHFPL1Q86WI0 220 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 MRGPRFQ96AM1 343 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 UBQLN2Q9UHD9 624 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 RND3P61587 244 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 ZNF114Q8NC26 417 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 C20orf24Q9BUV8 137 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 ALMS1Q8TCU4 4167 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 C15orf62A8K5M9 175 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 GABARAPO95166 117 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 MT-CO2P00403 227 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 CD3DP04234 171 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 SMIM18P0DKX4 95 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 PI3P19957 117 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 MFAP4P55083 255 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 ODF3L2Q3SX64 289 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 OR52I2Q8NH67 350 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 MISP3Q96FF7 219 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 ABHD1Q96SE0 405 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 TXN2Q99757 166 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 EXTL2Q9UBQ6 330 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 MTFP1Q9UDX5 166 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 SMPXQ9UHP9 88 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 CHEK1O14757 476 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 IGKV1-5P01602 117 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 P0C879 139 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 PGAM2P15259 253 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 PIGPP57054 158 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 ERHP84090 104 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 RELQ04864 619 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 WFDC3Q8IUB2 231 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 ARRDC1Q8N5I2 433 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 AP3S1Q92572 193 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 OR10C1Q96KK4 312 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 TP53RKQ96S44 253 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 BIRC6Q9NR09 4857 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 A0A0B4J293 547 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 IGHV3-48P01763 117 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 GPR107Q5VW38 600 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 OR4D10Q8NGI6 311 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 RNF2Q99496 336 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-229ENST00000551936 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms