RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	PREX2	Q70Z35	1606 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	SCN5A	Q14524	2016 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ABCC3	O15438	1527 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	NDUFS5	O43920	106 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	VDAC1	P21796	283 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TLCD2	A6NGC4	264 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	PDCD6	O75340	191 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	CA6	P23280	308 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	GNB2	P62879	340 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	WDR86	Q86TI4	376 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	MBD6	Q96DN6	1003 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	CUX1	P39880	1505 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	FRG2	Q64ET8	278 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	C4orf51	C9J302	202 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	SYNGR2	O43760	224 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	IGHA1	P01876	353 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	NPC2	P61916	151 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	OR9G1	Q8NH87	305 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	FGF14	Q92915	247 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	GNG13	Q9P2W3	67 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	LTN1	O94822	1766 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483		A0A1B0GXF2	115 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	LY6L	H3BQJ8	138 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	UBE2L6	O14933	153 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF737	O75373	536 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	NMS	Q5H8A3	153 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	SIX2	Q9NPC8	291 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	JTB	O76095	146 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	GLI4	P10075	376 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	CRYGS	P22914	178 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM182B	Q5T319	152 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483		K7ERJ3	54 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	CST7	O76096	145 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	NCR2	O95944	276 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	HLA-DOB	P13765	273 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	LMO1	P25800	156 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	C4orf45	Q96LM5	186 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TIMM17A	Q99595	171 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ZFP92	A6NM28	416 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483		K7N7A8	449 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	COX6A1	P12074	109 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	HERVK_113	P61574	105 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	CST6	Q15828	149 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	STPG1	Q5TH74	334 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	DRAM1	Q8N682	238 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	PLXNC1	O60486	1568 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	IQGAP2	Q13576	1575 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		3.1	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms