RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	LYNX1	P0DP58	116 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	DERL1	Q9BUN8	251 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	C11orf94	C9JXX5	98 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	COL8A2	P25067	703 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	THBS3	P49746	956 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM78B	Q5VT40	261 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF709	Q8N972	641 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	OR4S2	Q8NH73	311 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	MB	P02144	154 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	ERVK-16	P61578	105 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	CST9LP1	Q5W188	147 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	ATP5G3	P48201	142 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	PPOX	P50336	477 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	AARD	Q4LEZ3	155 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	OR4A16	Q8NH70	328 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	NDUFB4	O95168	129 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	HNF1A	P20823	631 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	IL3RA	P26951	378 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	UQCRFS1	P47985	274 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF114	Q8NC26	417 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM140	Q9NV12	185 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	CT45A6	P0DMU7	189 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	CT45A5	P0DMU8	189 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	CT45A7	P0DMV0	189 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	GNB1	P62873	340 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	ATP6V1F	Q16864	119 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	ACY3	Q96HD9	319 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A0U1RQK1	487 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF320	A2RRD8	509 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	SOX15	O60248	233 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	RELB	Q01201	579 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC01551	Q86U37	167 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	LRBA	P50851	2863 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		12.77	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		12.77	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		12.77	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		12.77	□□□□□ -0.36
GRSF1-208	ENST00000545193	FSTL3	O95633	263 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	GNLY	P22749	145 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	PDLIM4	P50479	330 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	DLX6	P56179	175 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM18	Q96B42	140 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	NUPR1	O60356	82 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	GCG	P01275	180 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	ABCA4	P78363	2273 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	SCGB1D1	O95968	90 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	CD33	P20138	364 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	OR4A47	Q6IF82	309 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193		Q8N7P7	452 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	OR52E5	Q8NH55	327 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	HCFC1	P51610	2035 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	C15orf62	A8K5M9	175 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	IGKV1-16	P04430	117 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	RAB4A	P20338	218 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	TEX38	Q6PEX7	206 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	LY6H	O94772	140 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	RTL8B	Q17RB0	113 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GRSF1-208	ENST00000545193		J3QR06	171 aa		12.75	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms