RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.71□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MFFQ9GZY8 342 aa6.71□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.71□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.71□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.71□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.348e-7■■■■□ 20.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGSF23A1L1A6 192 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 G3V318 75 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AP4M1O00189 453 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CYB5BO43169 146 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CST7O76096 145 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NHLH2Q02577 135 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MISP3Q96FF7 219 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 P2RX4Q99571 388 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF702PQ9H963 129 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CREBBPQ92793 2442 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ABCA1O95477 2261 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A0D9SG52 128 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C15orf62A8K5M9 175 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FBXO24O75426 580 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRH1P02810 166 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGF1P05019 195 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRYGCP07315 174 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CTRB1P17538 263 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CXCL2P19875 107 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SULT1A1P50225 295 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR2F1Q13607 317 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C2orf83Q53S99 150 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMUB2Q71RG4 321 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STPG2Q8N412 459 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR1P1Q8NH06 330 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MS4A10Q96PG2 267 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AQP10Q96PS8 301 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GON7Q9BXV9 100 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HSPB11Q9Y547 144 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AKAP9Q99996 3911 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 S100A11P31949 105 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MFAP2P55001 183 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HBG1P69891 147 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HBG2P69892 147 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC35B1P78383 322 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BAXQ07812 192 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARL16Q0P5N6 197 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLINT1Q14677 625 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BSXQ3C1V8 233 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q6ZSV7 163 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LILRB2Q8N423 598 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF114Q8NC26 417 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARL6Q9H0F7 186 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMCO3A2RU48 225 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSMB11A5LHX3 300 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF222A6NCQ9 220 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CORTO00230 105 aa6.67□□□□□ -1.34
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