RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520808.6

NPIPB4-205, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 4

Gene NPIPB4, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-205	ENST00000520808	RAB5A	P20339	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CCKAR	P32238	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	OPRK1	P41145	380 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF134	P52741	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CEBPG	P53567	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	LYG1	Q8N1E2	194 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CCL13	Q99616	98 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808		A0A1W2PPE2	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808		A0A1W2PPH5	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF727	A8MUV8	499 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808		B9A039	149 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CLDN34	H7C241	214 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	MT-CO2	P00403	227 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	NPY1R	P25929	384 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	AKR1C3	P42330	323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CCL8	P80075	99 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	EFNB3	Q15768	340 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM201A	Q5SY85	155 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR5B3	Q8NH48	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR4A5	Q8NH83	315 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF714	Q96N38	554 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TNC	P24821	2201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ATR	Q13535	2644 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808		A0A1W2PN81	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808		F6UZH7	168 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808		J3QR06	171 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	UPK2	O00526	184 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC31A2	O15432	143 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	PDE6D	O43924	150 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	KBTBD11	O94819	623 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	FSTL3	O95633	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	OPN1MW	P04001	364 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	S100A8	P05109	93 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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