RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 OBP2BQ9NPH6 170 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 FRYLO94915 3013 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF716A6NP11 495 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 DEGS1O15121 323 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 NPY1RP25929 384 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 BORCS8Q96FH0 119 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 C3orf80F5H4A9 247 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 ARF6P62330 175 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 HIST3H3Q16695 136 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00470Q9BZP3 86 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 IL36RNQ9UBH0 155 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 ICE1Q9Y2F5 2266 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 NOTCH2Q04721 2471 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 A0A087X0K7 114 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 C5orf49A4QMS7 147 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 NPIPB13A6NJU9 1138 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 NPIPB4C9JG80 1138 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 M0R135 149 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 M0R1X1 148 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 TUSC2O75896 110 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 PPOXP50336 477 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 RBM11P57052 281 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 FXYD3Q14802 87 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 C19orf35Q6ZS72 473 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF799Q96GE5 643 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 PATE4P0C8F1 98 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF32P17041 273 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 OR8B8Q15620 311 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 RPEL1Q2QD12 228 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 SPSB1Q96BD6 273 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM38BQ9NVV0 291 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 EML6Q6ZMW3 1958 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 RAMP3O60896 148 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 V9GYV3 84 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 RRHO14718 337 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 RHOBP62745 196 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 TIMM23BQ5SRD1 257 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 PHYHD1Q5SRE7 291 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 STPG3Q8N7X2 389 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 HES4Q9HCC6 221 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 AKAP6Q13023 2319 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 CACNA1DQ01668 2161 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 PPIAL4EA0A075B759 164 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 C2orf70A6NJV1 201 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 PPIAL4DF5H284 164 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 PPIAL4FP0DN26 164 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 NPVFQ9HCQ7 196 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 GAGE10A6NGK3 116 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 RPL31P62899 125 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 SLAQ13239 276 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF718Q3SXZ3 478 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 SPINK9Q5DT21 86 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 OR1F12Q8NHA8 337 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 MED12LQ86YW9 2145 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 FAM231BA6NCW3 169 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 REG1AP05451 166 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A6P12236 298 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 FABP6P51161 128 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 EDDM3BP56851 147 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 PCSK4Q6UW60 755 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 M0R2Z0 102 aa8.34□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 PLA2G2AP14555 144 aa8.34□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 AZU1P20160 251 aa8.34□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV1-2P23083 117 aa8.34□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 GABRA6Q16445 453 aa8.34□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF585BQ52M93 769 aa8.34□□□□□ -1.08
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