RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 RNF7Q9UBF6 113 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0G2JNJ9 132 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 J3QR06 171 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 IGLC2P0DOY2 106 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 IGLC3P0DOY3 106 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 SPINK9Q5DT21 86 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZR03 302 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 IL22RA2Q969J5 263 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 AQP10Q96PS8 301 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 CCL13Q99616 98 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 Q9UFV3 132 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 METRNQ9UJH8 293 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 WIPF1O43516 503 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 HYPMO75409 117 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 GYPAP02724 150 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 BSPH1Q075Z2 132 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 LEAP2Q969E1 77 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 K7ENP7 123 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 FCGR3BO75015 233 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF146Q15072 292 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf174Q8IYL3 243 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 DRAM1Q8N682 238 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ODAMA1E959 279 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TSPOP30536 169 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 G6PCP35575 357 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 UCNP55089 124 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 GAGE5Q13069 117 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 GAGE6Q13070 117 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA45Q537H7 98 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 Q6P435 159 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 DERL1Q9BUN8 251 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 H0Y980 276 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 SLC17A3O00476 420 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 MGST3O14880 152 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 C1QL1O75973 258 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 CLDN14O95500 239 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 CTRLP40313 264 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 LINC01560Q8TB33 94 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 RAB9BQ9NP90 201 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 PSENENQ9NZ42 101 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 C1QTNF9P0C862 333 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 DANCRP0C864 163 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 IGLC1P0CG04 106 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 TPPP2P59282 170 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 HSD52Q0P140 79 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 PRR7Q8TB68 274 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ENY2Q9NPA8 101 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 M0QXV9 152 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 SCGB2A1O75556 95 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 CGAP01215 116 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 CD3EP07766 207 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 CD99P14209 185 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 HBG1P69891 147 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 HBG2P69892 147 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 PCSK4Q6UW60 755 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 OR4A16Q8NH70 328 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 TNCP24821 2201 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 IGSF23A1L1A6 192 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 SYNGR2O43760 224 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 S1PR2O95136 353 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 EGR1P18146 543 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 P2RY1P47900 373 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 DYNLT3P51808 116 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms