RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.56□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 C5orf52A6NGY3 159 aa14.56□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 CENPWQ5EE01 88 aa14.56□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 CLEC19AQ6UXS0 136 aa14.56□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 NR2C2APQ86WQ0 139 aa14.56□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 LYNX1G3V0Z9 82 aa14.55□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 LYNX1P0DP58 116 aa14.55□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 ZP1P60852 638 aa14.55□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 TUBA4BQ9H853 241 aa14.55□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa14.55□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.55□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.55□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.55□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 PVRIGQ6DKI7 326 aa14.55□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 CD69Q07108 199 aa14.55□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF502Q8TBZ5 544 aa14.55□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 VN1R17PQ8TDU5 208 aa14.55□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 SFRP2Q96HF1 295 aa14.55□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 KIR2DL4Q99706 377 aa14.55□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 NUDT3O95989 172 aa14.55□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 HERPUD1Q15011 391 aa14.55□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 KIF26BQ2KJY2 2108 aa14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 H7C1H1 209 aa14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV3-23P01764 117 aa14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 FHITP49789 147 aa14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 CRXO43186 299 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 GGCTO75223 188 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 CEACAM4O75871 244 aa14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 OOSP1A8MZH6 123 aa14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 HLA-DRB1P01911 266 aa14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 TRGC2P03986 189 aa14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 C18orf12Q96KH6 178 aa14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 VWA8A3KMH1 1905 aa14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 LEPROTL1O95214 131 aa14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM169BQ8N8A8 192 aa14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A0G2JNJ9 132 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 PPP1R17O96001 155 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF56Q15929 161 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF525Q8N782 197 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 Q9UFV3 132 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 B3GALT5-AS1P59052 145 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 SGK494Q96LW2 274 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 MDKP21741 143 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 GNLYP22749 145 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM70Q9BUB7 260 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 TFF3Q07654 80 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 S4R3C0 116 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa14.52□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 PMCHL1Q16048 86 aa14.52□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A087X0M5 115 aa14.52□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A1B0GX30 115 aa14.52□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 ATG101Q9BSB4 218 aa14.52□□□□□ -0.08
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 PEX7O00628 323 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 CGAP01215 116 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV1D-12P01611 117 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 WNT2P09544 360 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 GLRX5Q86SX6 157 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV3-20P01619 116 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 ASIPP42127 132 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 PRCDQ00LT1 54 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 CACNA1HO95180 2353 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM178BH3BS89 294 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 TIMM23O14925 209 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 IFITM2Q01629 132 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 OR10AG1Q8NH19 301 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 COL6A6A6NMZ7 2263 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 CACNA1BQ00975 2339 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 OR9G9P0C7N8 305 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 HBBP68871 147 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM74A4Q5TZK3 123 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 FMC1Q96HJ9 113 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 PI4KAP42356 2102 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 K7ENP7 123 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 PAM16Q9Y3D7 125 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 A6NJY4 79 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 MINOS1Q5TGZ0 78 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV3-11P01762 117 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms