RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF45Q02386 682 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 TNFRSF9Q07011 255 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ST3GAL4Q11206 333 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ATP6AP1Q15904 470 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC36Q1X8D7 754 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 AKIRIN2Q53H80 203 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 NHLRC3Q5JS37 347 aa3.13□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 OR6V1Q8N148 313 aa3.13□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF714Q96N38 554 aa3.13□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 PLEKHA1Q9HB21 404 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 BCL2L10Q9HD36 194 aa3.13□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 KMT2AQ03164 3969 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 TRAPPC13A5PLN9 417 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ARRDC5A6NEK1 342 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 RFPL4AA6NLU0 287 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 IGLL5B9A064 214 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 M0R135 149 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 AGPAT2O15120 278 aa3.12□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF823P16415 610 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 M6PRP20645 277 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 PSMB8P28062 276 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 MAS1LP35410 378 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 RUNX1Q01196 453 aa3.12□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 C1orf146Q5VVC0 180 aa3.12□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 SLC35F6Q8N357 371 aa3.12□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 OR4P4Q8NGL7 312 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 PFN4Q8NHR9 129 aa3.12□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 REEP1Q9H902 201 aa3.12□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 OR11H12B2RN74 326 aa3.11□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 K7N7A8 449 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 M0QXV9 152 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 IGKV1D-33P01593 117 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 IGKV1-33P01594 117 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 PGAM2P15259 253 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 AQP1P29972 269 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 FMO3P31513 532 aa3.11□□□□□ -1.91
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