RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM56Q96MV1 263 aa14.71□□□□□ -0.05
USP46-AS1-201ENST00000503051 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.71□□□□□ -0.05
USP46-AS1-201ENST00000503051 DNAH9Q9NYC9 4486 aa14.71□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A0B4J293 547 aa14.7□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A0G2JRQ6 117 aa14.7□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 A6NHS1 94 aa14.7□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 CDS2O95674 445 aa14.7□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 AKR1C4P17516 323 aa14.7□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRCDQ00LT1 54 aa14.7□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMED4Q7Z7H5 227 aa14.7□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 HAPLN4Q86UW8 402 aa14.7□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 GALNT14Q96FL9 552 aa14.7□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 S4R3C0 116 aa14.7□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 BMPR1BO00238 502 aa14.69□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGHV3-23P01764 117 aa14.69□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 SYNJ2BPP57105 145 aa14.69□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 TATDN3Q17R31 274 aa14.69□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 CNPY1Q3B7I2 92 aa14.69□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.69□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR9G4Q8NGQ1 327 aa14.69□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC140Q96MF4 163 aa14.69□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 PLEKHA3Q9HB20 300 aa14.69□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRR13Q9NZ81 148 aa14.69□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 MFSD2BA6NFX1 497 aa14.68□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 CYB5BO43169 146 aa14.68□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 IL7P13232 177 aa14.68□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM187Q14656 261 aa14.68□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPINK9Q5DT21 86 aa14.68□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM209BQ5JX69 171 aa14.68□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM219AQ8IW50 185 aa14.68□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa14.68□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa14.68□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa14.68□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa14.67□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 PPP5D1E7EU14 171 aa14.67□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 ST8SIA3O43173 380 aa14.67□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 MFAP2P55001 183 aa14.67□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC35G3Q8N808 338 aa14.67□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 CXorf58Q96LI9 332 aa14.67□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 ASCL2Q99929 193 aa14.67□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 THYN1Q9P016 225 aa14.67□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 NAP1L6A6NFF2 107 aa14.66□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 ANXA3P12429 323 aa14.66□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCR6P51684 374 aa14.66□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC25A24Q6NUK1 477 aa14.66□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 CLEC19AQ6UXS0 136 aa14.66□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR2C3Q8N628 320 aa14.66□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 IL22RA2Q969J5 263 aa14.66□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.66□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 PEMTQ9UBM1 199 aa14.66□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 U3KQK5 164 aa14.66□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa14.65□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 IFNA17P01571 189 aa14.65□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 SRPXP78539 464 aa14.65□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q6ZRM9 215 aa14.65□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF114Q8NC26 417 aa14.65□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR1P1Q8NH06 330 aa14.65□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa14.65□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 CACNG5Q9UF02 275 aa14.65□□□□□ -0.06
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGLV1-51P01701 117 aa14.64□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 BTCP35070 178 aa14.64□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARL3P36405 182 aa14.64□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM128Q5BJH2 165 aa14.64□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.64□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 CENPSQ8N2Z9 138 aa14.64□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR1L6Q8NGR2 347 aa14.64□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF502Q8TBZ5 544 aa14.64□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 GPR146Q96CH1 333 aa14.64□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 PTTG2Q9NZH5 202 aa14.64□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A0B4J2A0 478 aa14.63□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 CENPXA8MT69 81 aa14.63□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 GGCTO75223 188 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 NDUFB6O95139 128 aa14.63□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 VAMP1P23763 118 aa14.63□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 GPR183P32249 361 aa14.63□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 AARDQ4LEZ3 155 aa14.63□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 LGI3Q8N145 548 aa14.63□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 VN1R17PQ8TDU5 208 aa14.63□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.63□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa14.62□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 K7EIM0 57 aa14.62□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 ERHP84090 104 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 PPP1R1AQ13522 171 aa14.62□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 LCN12Q6JVE5 192 aa14.62□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC32Q9BV29 185 aa14.62□□□□□ -0.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms