RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 SFT2D2O95562 160 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 IGHV3-23P01764 117 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 OR8U8P0C7N1 319 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 DEFA4P12838 97 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 MFAP2P55001 183 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 PRCDQ00LT1 54 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 ATP5G2Q06055 141 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 PPP1R1AQ13522 171 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 ZNF846Q147U1 533 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 KLK9Q2XQG4 91 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 C15orf32Q32M92 178 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 ZNF429Q86V71 674 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 NECAP1Q8NC96 275 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 DCUN1D4Q92564 292 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 DPF1Q92782 380 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 IL22RA2Q969J5 263 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 NXPH3O95157 252 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 DHFRP00374 187 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 ANXA3P12429 323 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 IFITM3Q01628 133 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 FAM219AQ8IW50 185 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 LGI3Q8N145 548 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 OR2C3Q8N628 320 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 CCDC140Q96MF4 163 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 CACNG5Q9UF02 275 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 A0A0B4J2A0 478 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 PPP5D1E7EU14 171 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 OVOL1O14753 267 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 UPK1BO75841 260 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 IFNA17P01571 189 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 AARDQ4LEZ3 155 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 NMSQ5H8A3 153 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 C9orf170A2RU37 121 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 BMPR1BO00238 502 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 TCRBP04435 133 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 OR4E1P0C645 316 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 ZP3P21754 424 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 SPCS3P61009 180 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 SRPXP78539 464 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 DEFA6Q01524 100 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 LRTM2Q8N967 370 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 ZNF114Q8NC26 417 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 OR1P1Q8NH06 330 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 OR52E5Q8NH55 327 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 K7EIM0 57 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 HOXB5P09067 269 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 SYNJ2BPP57105 145 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 KRTAP10-11P60412 298 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 DHRS2Q13268 280 aa6.62□□□□□ -1.35
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