RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 STPG3Q8N7X2 389 aa12.28□□□□□ -0.44
SH3BP4-210ENST00000489601 HINT2Q9BX68 163 aa12.28□□□□□ -0.44
SH3BP4-210ENST00000489601 FKBP11Q9NYL4 201 aa12.28□□□□□ -0.44
SH3BP4-210ENST00000489601 NSG2Q9Y328 171 aa12.28□□□□□ -0.44
SH3BP4-210ENST00000489601 C15orf62A8K5M9 175 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 PMP2P02689 132 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 G6PCP35575 357 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 TAS2R46P59540 309 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 UBE2NLQ5JXB2 153 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 OR5B3Q8NH48 314 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 GALNT14Q96FL9 552 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM56Q96MV1 263 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 C20orf24Q9BUV8 137 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 PRNDQ9UKY0 176 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 GPR31O00270 319 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 CTSGP08311 255 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 TAS2R20P59543 309 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 NEDD8Q15843 81 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 Q56UQ5 140 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 UBAC2Q8NBM4 344 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 TSPAN14Q8NG11 270 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 OR5H2Q8NGV7 314 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 OR6F1Q8NGZ6 308 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 OR1P1Q8NH06 330 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 TSC22D3Q99576 134 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 FXYD6Q9H0Q3 95 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 MAP6D1Q9H9H5 199 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM14BQ9NUH8 114 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 SMPXQ9UHP9 88 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM69Q5SWH9 247 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM217Q8N7C4 229 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF414Q96IQ9 312 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 DBX1A6NMT0 343 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 C15orf61A6NNL5 157 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 CHEK1O14757 476 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 PRSS3P35030 304 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 RPS19P39019 145 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 RELQ04864 619 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 KCTD21Q4G0X4 260 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 LYSMD2Q8IV50 215 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 OR10C1Q96KK4 312 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 RNF2Q99496 336 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 TXN2Q99757 166 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 I3L2K1 104 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 TGFBR1P36897 503 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 MFAP4P55083 255 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 LPCAT3Q6P1A2 487 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 SAMD12Q8N8I0 201 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 S100GP29377 79 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 HRH1P35367 487 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF114Q8NC26 417 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM116Q8NCL8 245 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 SEC22AQ96IW7 307 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 CSTL1Q9H114 145 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 HLA-DMAP28067 261 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 PHLDA2Q53GA4 152 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM90A2PQ658T7 463 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 APRG1Q8IVJ8 170 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 GPX8Q8TED1 209 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 GATAD1Q8WUU5 269 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC25A46Q96AG3 418 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 MISP3Q96FF7 219 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP4-210ENST00000489601 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 YIF1AO95070 293 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 MT-CO2P00403 227 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 UCP3P55916 312 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 TSPAN5P62079 268 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 PRCDQ00LT1 54 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 TBC1D26Q86UD7 250 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 OR4A16Q8NH70 328 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 YIPF6Q96EC8 236 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 CMTM3Q96MX0 182 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 MPTX1A8MV57 137 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 IGKV1-39P01597 117 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 IGKV1D-39P04432 117 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 CD5P06127 495 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF124Q15973 351 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 GNG7O60262 68 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 TFPI2P48307 235 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 LSM3P62310 102 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 ERHP84090 104 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-210ENST00000489601 RARRES2Q99969 163 aa12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms