RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 RAB29O14966 203 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 RAMP3O60896 148 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 OR5AC1P0C628 307 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 IL3RAP26951 378 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 DUTP33316 252 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 LPAR6P43657 344 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 RAB7AP51149 207 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 BPIFB3P59826 476 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R1AQ13522 171 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 OXA1LQ15070 435 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 LY6EQ16553 131 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 DEFB112Q30KQ8 113 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 LY6G6FQ5SQ64 297 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 PLET1Q6UQ28 207 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SLC38A6Q8IZM9 456 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00311Q8N616 119 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 THAP8Q8NA92 274 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 DUSP18Q8NEJ0 188 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 NANPQ8TBE9 248 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ZFAND1Q8TCF1 268 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 RPEQ96AT9 228 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TP53RKQ96S44 253 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 S1PR3Q99500 378 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 NABP2Q9BQ15 211 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SLC2A8Q9NY64 477 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 PIPOXQ9P0Z9 390 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 DPM3Q9P2X0 92 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 NUP50Q9UKX7 468 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SVEP1Q4LDE5 3571 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TLN2Q9Y4G6 2542 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 HIVEP1P15822 2718 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PPI3 338 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 VGLL3A8MV65 326 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ITGB1BP1O14713 200 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CRYZL1O95825 349 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 PTTG1O95997 202 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV1D-33P01593 117 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV1-33P01594 117 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV4-59P01825 116 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 OR4E1P0C645 316 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CNTFRP26992 372 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CEACAM3P40198 252 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 DHRS2Q13268 280 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 HES1Q14469 280 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD55Q3KP44 614 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 LPCAT3Q6P1A2 487 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SSX9Q7RTT3 188 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A42Q86VD7 318 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SGPP2Q8IWX5 399 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CMTM1Q8IZ96 169 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SPAG16Q8N0X2 631 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ZDHHC22Q8N966 263 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 C8orf31Q8N9H6 132 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 LHFPL5Q8TAF8 219 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CHPT1Q8WUD6 406 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 DEDD2Q8WXF8 326 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 MALSU1Q96EH3 234 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 AKR1E2Q96JD6 320 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SCGB3A2Q96PL1 93 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SSX3Q99909 188 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 MARVELD1Q9BSK0 173 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 NAA60Q9H7X0 242 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SRD5A3Q9H8P0 318 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SLC35D1Q9NTN3 355 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ALG5Q9Y673 324 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SONP18583 2426 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV3A0A0B4J244 114 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 C9orf170A2RU37 121 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 H0YJW9 148 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 H3BUX3 64 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 CCSO14618 274 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 PRAF2O60831 178 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 ADAP1O75689 374 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 SLC22A5O76082 557 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 S1PR2O95136 353 aa3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms