RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 SSX2Q16385 188 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 FAM120AOSQ5T036 256 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 SLC25A24Q6NUK1 477 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 BTNL8Q6UX41 500 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 C19orf35Q6ZS72 473 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF429Q86V71 674 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 SYT8Q8NBV8 401 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 BPIFCQ8NFQ6 507 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 OR4C13Q8NGP0 309 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 OR52E5Q8NH55 327 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 FAM213BQ8TBF2 198 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 SCGB1C1Q8TD33 95 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 CFHR4Q92496 578 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 AJUBAQ96IF1 538 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 LINC00052Q96N35 136 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM231Q9H6L2 316 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 MED9Q9NWA0 146 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM160Q9NX00 188 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 BET1LQ9NYM9 111 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 PRNDQ9UKY0 176 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 FAM96BQ9Y3D0 163 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 CELSR2Q9HCU4 2923 aa4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 SMCO3A2RU48 225 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 PGPEP1LA6NFU8 196 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF785A8K8V0 405 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 A8MXK9 166 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 PRSS46E5RG02 174 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 DFFBO76075 338 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 VENTXO95231 258 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 IFNA4P05014 189 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 REG1AP05451 166 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 CRYGBP07316 175 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 FGF2P09038 288 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 OR8U8P0C7N1 319 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 PLA2G2AP14555 144 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 MC5RP33032 325 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 RAB13P51153 203 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 ARHGDIBP52566 201 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 GNB1P62873 340 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 HBG1P69891 147 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 HBG2P69892 147 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 PRCDQ00LT1 54 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF616Q08AN1 781 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF266Q14584 549 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 VMA21Q3ZAQ7 101 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 CLEC2AQ6UVW9 174 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 SSX7Q7RTT5 188 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 STPG2Q8N412 459 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 KIR3DL3Q8N743 410 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 OR10P1Q8NGE3 313 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 MARC2Q969Z3 335 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM147Q9BVK8 224 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 HIPK2Q9H2X6 1198 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 FBXL15Q9H469 300 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 ENY2Q9NPA8 101 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 UQCC1Q9NVA1 299 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 DPM3Q9P2X0 92 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 KPTNQ9Y664 436 aa4.89□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 C9JQL5 133 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 FOXH1O75593 365 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 SCO1O75880 301 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 IGKV1D-33P01593 117 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 IGKV1-33P01594 117 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 IGHV3-48P01763 117 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 DEFA4P12838 97 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 USF1P22415 310 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 NPY1RP25929 384 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 LGALS7P47929 136 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 RAB2AP61019 212 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 BLOC1S1P78537 153 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 WT1-ASQ06250 92 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF726P1Q15940 193 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 TNXAQ16473 311 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 PRSS8Q16651 343 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 VWC2Q2TAL6 325 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 ACSM6Q6P461 480 aa4.88□□□□□ -1.63
SKAP2-204ENST00000481204 SPSB3Q6PJ21 355 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms