RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	OR2J3	O76001	311 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	ATP5G2	Q06055	141 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	ASAH1	Q13510	395 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	C15orf32	Q32M92	178 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	FAM209B	Q5JX69	171 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	OR2C3	Q8N628	320 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF114	Q8NC26	417 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	OR52E5	Q8NH55	327 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	GPR146	Q96CH1	333 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	CACNG5	Q9UF02	275 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	C9orf170	A2RU37	121 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887		G3V4G9	280 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	CYB5B	O43169	146 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	WIPF1	O43516	503 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	NDUFB8	O95169	186 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	DEFA4	P12838	97 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	IGLL1	P15814	213 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	MFAP2	P55001	183 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	SPCS3	P61009	180 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	IFITM3	Q01628	133 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	OR1P1	Q8NH06	330 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	DPF1	Q92782	380 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	CCDC140	Q96MF4	163 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	BMPR1B	O00238	502 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	IFNA17	P01571	189 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	TRBV12-3	P01733	135 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	TCRB	P04435	133 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	OR4E1	P0C645	316 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	ZP3	P21754	424 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	SLURP1	P55000	103 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	RAB25	P57735	213 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	DHRS2	Q13268	280 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	SMCO1	Q147U7	214 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	SPINK9	Q5DT21	86 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	LYG2	Q86SG7	212 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	DCUN1D4	Q92564	292 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	CXorf58	Q96LI9	332 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	NUDT15	Q9NV35	164 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	THYN1	Q9P016	225 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887		A0A1B0GU03	582 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887		K7EIM0	57 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	OVOL1	O14753	267 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	PITX3	O75364	302 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	SLC25A6	P12236	298 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	BSX	Q3C1V8	233 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	C4orf46	Q504U0	113 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	COQ8A	Q8NI60	647 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	ATP6V0B	Q99437	205 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SFI1-222	ENST00000478887	TNFRSF9	Q07011	255 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SFI1-222	ENST00000478887	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SFI1-222	ENST00000478887	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SFI1-222	ENST00000478887	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SFI1-222	ENST00000478887	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SFI1-222	ENST00000478887	C1QL4	Q86Z23	238 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SFI1-222	ENST00000478887	MITD1	Q8WV92	249 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SFI1-222	ENST00000478887	ENY2	Q9NPA8	101 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SFI1-222	ENST00000478887		S4R3C0	116 aa		7.27	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms