RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467683.5

UBE2Q1-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 370 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZNF773Q6PK81 442 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 CADM3Q8N126 398 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 GPHA2Q96T91 129 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 GINS3Q9BRX5 216 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 DUSP21Q9H596 190 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 K7EIM0 57 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 SULT1C2O00338 296 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 PPYP01298 95 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 AMBPP02760 352 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 CTSGP08311 255 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 HLA-DMBP28068 263 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 STHQ8IWL8 128 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 TMEM56Q96MV1 263 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 TXN2Q99757 166 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 MARCH11A6NNE9 402 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 YIF1AO95070 293 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 SPP1P10451 314 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 FCGR2CP31995 323 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 Q6ZTC4 211 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 TCF24Q7RTU0 167 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 PRSS48Q7RTY5 328 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 BEST4Q8NFU0 473 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 OR1P1Q8NH06 330 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 SSX5O60225 188 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 SNAPC5O75971 98 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 MFAP4P55083 255 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 DEFB131AP59861 70 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 AADACL3Q5VUY0 350 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 OR51H1Q8NH63 302 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 HINT2Q9BX68 163 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 NDUFB11Q9NX14 153 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 FKBP11Q9NYL4 201 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 PRNDQ9UKY0 176 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 NOTOA8MTQ0 251 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 RTL8CO15255 209 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 ST8SIA3O43173 380 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 LEMD1Q68G75 181 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZNF367Q7RTV3 350 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 TSC22D3Q99576 134 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 VSIRQ9H7M9 311 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.34□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 EBAG9O00559 213 aa8.34□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 GNG7O60262 68 aa8.34□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 F2RP25116 425 aa8.34□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 FXYD4P59646 89 aa8.34□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.34□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 HOGA1Q86XE5 327 aa8.34□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.34□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.34□□□□□ -1.07
UBE2Q1-202ENST00000467683 HSPG2P98160 4391 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 A0A1W2PS18 150 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 I3L2K1 104 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 SCAND1P57086 179 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 HERV-K104P61576 105 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 TPRA1Q86W33 373 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 TMEM17Q86X19 198 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZNF114Q8NC26 417 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 ST8SIA2Q92186 375 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 MISP3Q96FF7 219 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 RHBDL2Q9NX52 303 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 TBC1D24Q9ULP9 559 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2Q1-202ENST00000467683 X6R8D5 127 aa8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms