RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 CEACAM18A8MTB9 384 aa9.86□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 LOXL4Q96JB6 756 aa9.86□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 FXYD3Q14802 87 aa9.86□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 GAGE13Q4V321 117 aa9.86□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 CACNG8Q8WXS5 425 aa9.86□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa9.86□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.86□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 BRWD3Q6RI45 1802 aa9.86□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 A1L4Q6 167 aa9.86□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.86□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 H3BUT2 72 aa9.86□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 FOXC2Q99958 501 aa9.86□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 CEP290O15078 2479 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 K7N7A8 449 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 FBXW9Q5XUX1 488 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 REG4Q9BYZ8 158 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 S4R3C0 116 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 UNC13CQ8NB66 2214 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 HOXA5P20719 270 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 SGMS2Q8NHU3 365 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 ITLN1Q8WWA0 313 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 SBF1O95248 1867 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 PGA5P0DJD9 388 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 ABHD17AQ96GS6 310 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 TET1Q8NFU7 2136 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 G3V4G9 280 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 J3QT63 122 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 FAM27BQ5VT28 67 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 GZMHP20718 246 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 OR10S1Q8NGN2 331 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 RAXQ9Y2V3 346 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 OTOFQ9HC10 1997 aa9.85□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 UBE2E1P51965 193 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 SMIM8Q96KF7 97 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 PARLQ9H300 379 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 LOC285556D6RIA3 1793 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 SCTP09683 121 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 CCL19Q99731 98 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 DCTN5Q9BTE1 182 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 C21orf140B9A014 251 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 C9JAW5 83 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 SERF2P84101 59 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 RNF138Q8WVD3 245 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 K7EN84 100 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 HYPMO75409 117 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 HOXA6P31267 233 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 SYT8Q8NBV8 401 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 J3QW42 95 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 PPP1R17O96001 155 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 CKS2P33552 79 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 DAD1P61803 113 aa9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CCBE1-202ENST00000439986 KBTBD11O94819 623 aa9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 TRGC1P0CF51 173 aa9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 FAM106CPP0CH98 169 aa9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 C5orf64Q2M2E5 130 aa9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 PSG4Q00888 419 aa9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM187Q14656 261 aa9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 Q96M66 194 aa9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 RNF126Q9BV68 326 aa9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 H7C1H1 209 aa9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 IGHMP01871 453 aa9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 GDF15Q99988 308 aa9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 TRAV24A0A0B4J272 114 aa9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 A8MWV9 139 aa9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 NDUFB4O95168 129 aa9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 JMJD8Q96S16 334 aa9.83□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa9.82□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa9.82□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 A0A0G2JLM5 398 aa9.82□□□□□ -0.84
CCBE1-202ENST00000439986 PPBPP02775 128 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms