RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 SPCS3P61009 180 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-208ENST00000438888 GNB1P62873 340 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-208ENST00000438888 TNFRSF9Q07011 255 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-208ENST00000438888 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PRAME-208ENST00000438888 SLC35E3Q7Z769 313 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-208ENST00000438888 OR1L8Q8NGR8 309 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-208ENST00000438888 OR52E5Q8NH55 327 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-208ENST00000438888 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-208ENST00000438888 ST6GAL2Q96JF0 529 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-208ENST00000438888 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-208ENST00000438888 ZFP57Q9NU63 452 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-208ENST00000438888 HSPB7Q9UBY9 170 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-208ENST00000438888 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 WRBO00258 174 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 MED6O75586 246 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 CNIH1O95406 144 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 MBPP02686 304 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 MYOD1P15172 320 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 S100A10P60903 97 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 SLC35B1P78383 322 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 ID3Q02535 119 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 RAB32Q13637 225 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 DEFB136Q30KP8 78 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 C10orf55Q5SWW7 151 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 ZNF562Q6V9R5 426 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 LCNL1Q6ZST4 164 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 OR2T35Q8NGX2 323 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 HINT2Q9BX68 163 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 LINC01548A6NM66 108 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 CEBPZOSA8MTT3 80 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 K7EPK0 472 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 SSSCA1O60232 199 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 PFDN1O60925 122 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 PET100P0DJ07 73 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 PSMB6P28072 239 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 MYCNOSP40205 109 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 CX3CL1P78423 397 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 PRCDQ00LT1 54 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 FGL1Q08830 312 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 FXYD3Q14802 87 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 SPINK9Q5DT21 86 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 TCTE3Q8IZS6 198 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 STPG2Q8N412 459 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 ARPC1AQ92747 370 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 P2RX4Q99571 388 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 NEURL2Q9BR09 285 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 MAGT1Q9H0U3 335 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 RBKSQ9H477 322 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 PLEKHA3Q9HB20 300 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 ENY2Q9NPA8 101 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 SYNGR2O43760 224 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 MPC2O95563 127 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 NDPQ00604 133 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 ABHD5Q8WTS1 349 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 RAX2Q96IS3 184 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 PRR25Q96S07 402 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 A0A1B0GW64 132 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 A0A1W2PN81 502 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 CGB1A6NKQ9 187 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 E7EUB6 86 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 SMLR1H3BR10 107 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 L7N2F9 121 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 CCL24O00175 119 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 DEDDO75618 318 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 IGHG2P01859 326 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 RLN2P04090 185 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 CHRNA7P36544 502 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 VAMP2P63027 116 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 CD300CQ08708 224 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 Q5BKY6 102 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 THAP6Q8TBB0 222 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 DTD1Q8TEA8 209 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 RAB40CQ96S21 281 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 PARP11Q9NR21 331 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 RYR3Q15413 4870 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 MSGN1A6NI15 193 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 TEX22C9J3V5 150 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 G3V3Q6 166 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 H0YIZ8 118 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 ATP6V0E1O15342 81 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 LY86O95711 162 aa9.67□□□□□ -0.86
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