RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, human

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	PRR13	Q9NZ81	148 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	COMMD9	Q9P000	198 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	C9orf170	A2RU37	121 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	KRAS	P01116	189 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	CSN3	P07498	182 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	UCP1	P25874	307 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	AKR1C2	P52895	323 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	SRPX	P78539	464 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	DHRS2	Q13268	280 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM187	Q14656	261 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	HAGH	Q16775	308 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	LYG2	Q86SG7	212 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	LGI3	Q8N145	548 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	COQ8A	Q8NI60	647 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	APELA	P0DMC3	54 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	G6PC	P35575	357 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	RHOG	P84095	191 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	DEFA5	Q01523	94 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	ATP5G2	Q06055	141 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	MMD2	Q8IY49	270 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	TENM2	Q9NT68	2774 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	MARCH11	A6NNE9	402 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	PRAF2	O60831	178 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	CDS2	O95674	445 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	TRBV12-3	P01733	135 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	IL5	P05113	134 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	NECAP1	Q8NC96	275 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	IL17D	Q8TAD2	202 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM56	Q96MV1	263 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	OR2A7	Q96R45	310 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM140	Q9NV12	185 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028		A0A1B0GW64	132 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	IGKV1-39	P01597	117 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	IGKV1D-39	P04432	117 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	OXA1L	Q15070	435 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	OR4A47	Q6IF82	309 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	IL22RA2	Q969J5	263 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SNHG11-208	ENST00000437028	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	BMPR1B	O00238	502 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	SNAPC5	O75971	98 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	HOXB5	P09067	269 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	MYOD1	P15172	320 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	CD81	P60033	236 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	POU2AF1	Q16633	256 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC35G3	Q8N808	338 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	SEC22A	Q96IW7	307 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	LYST	Q99698	3801 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028		A0A0B4J2A0	478 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	KBTBD11	O94819	623 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	IFNA21	P01568	189 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	IGKV1-5	P01602	117 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	OR4A16	Q8NH70	328 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	OR4A5	Q8NH83	315 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	MITD1	Q8WV92	249 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	NEURL2	Q9BR09	285 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	BET1L	Q9NYM9	111 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	UPK2	O00526	184 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	SSNA1	O43805	119 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SNHG11-208	ENST00000437028	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54

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